Genetica resumen
Páginas: 8 (1873 palabras)
Publicado: 16 de diciembre de 2010
Resumen de articulo # 3
Composición genética de la población chilena. Distribución de polimorfismos de DNA mitocondrial en grupos originarios y en la población mixta de Santiago
El DNA mitocondrial humano tiene características únicas que lo hacen muy apropiado para estudios microevolutivos. Posee una alta frecuencia de mutaciones (5 a 10 veces mayor que el DNA nuclear), no sufrerecombinación génica y tiene una transmisión unidireccional por vía materna a lo largo de las generaciones5-7. Su secuencia, que se conoce totalmente desde el año 1981, comprende 16.569 pares de bases. Posee los genes para los RNA ribosomales 12s y 16s y para 22 RNAs de transferencia, además de otras 13 secuencias que codifican para proteínas implicadas en la maquinaria energética de la célula. El DNAmitocondrial tiene muy pocas regiones no codificantes, siendo la más importante la denominada región D-loop, que constituye el trozo más largo de secuencia no codificante con un largo de 1100 pares de bases. Además, la zona del D-loop posee un alto grado de polimorfismo, y es ahí donde se han centrado la mayoría de los estudios evolutivos recientes9,10.
Diversos trabajos realizados principalmente conpoblaciones de América del Norte y Central han mostrado que la distribución de frecuencias para los cuatro haplogrupos mitocondriales no es homogénea a lo largo del continente, observándose una elevada frecuencia del haplogrupo A en América del Norte. Por otra parte el haplogrupo B presenta una elevada frecuencia en algunas regiones de Centro América así como en el altiplano. Hemos podido determinarque la frecuencia de los haplogrupos C y D aumenta progresivamente en sentido norte sur, llegando a desaparecer los haplogrupos A y B en la población yamana.
El presente trabajo tiene por objeto comparar frecuencias de haplogrupos de mtDNA de las poblaciones originarias del norte y sur de Chile con el objeto de analizar el proceso de poblamiento de nuestro territorio. Hemos incluido además unaevaluación del aporte de mtDNA indígena a la población mixta de la ciudad de Santiago con la finalidad de reconstruir la distribución de haplogrupos de mtDNA de la población indígena que dio origen a esta.
MATERIAL Y MÉTODO
Se incluyeron en este estudio 120 individuos de origen aymará del interior de Arica y 23 de origen atacameño de San Pedro de Atacama y localidades vecinas. Como en todoslos estudios que involucran poblaciones originarias estas fueron definidas en base a criterios lingüísticos, geográficos y culturales. Las muestras fueron obtenidas hace más de una década dentro del marco de proyectos antropológicos que perseguían objetivos similares.
El DNA total fue extraído a partir de linfocitos de sangre periférica congelada. La amplificación de las cuatro regionespolimórficas del mtDNA que definen los cuatro haplotipos característicos de poblaciones Amerindias se realizó mediante la técnica de PCR. Con este fin se utilizaron las parejas de partidores descritos por Moraga y col4. La reacción de amplificación fue realizada en un volumen final de 50µl, conteniendo 300 ng de DNA genómico, una unidad de Taq DNA polimerasa (Promega), pmoles de cada partidor, 200nM decada desoxinucleótido y el tampón suministrado por la empresa. Las muestras fueron procesadas bajo las siguientes condiciones de PCR: un ciclo de denaturación inicial a 95°C por 5 min. seguido por 30 ciclos de 95°C por 1 min. 55°C por 1 min y 72°C por 1 min. Finalmente un ciclo de extensión final a 72°C por 5 min. Los haplogrupos A, C y D fueron analizados por digestión con las enzimas de restricciónrespectivas, usando Hae III para el haplotipo A, Hinc II para el haplotipo C y Alu I para el haplotipo D. El resultado de la digestión con enzimas de restricción así como el producto de PCR que incluye la región intergénica V, que define el haplotipo B, fueron analizadas por electroforesis en gel de NuSieve-Agarosa al 3% (FMC BioProducts).
Técnicas. El DNA total fue extraído a partir de...
Composición genética de la población chilena. Distribución de polimorfismos de DNA mitocondrial en grupos originarios y en la población mixta de Santiago
El DNA mitocondrial humano tiene características únicas que lo hacen muy apropiado para estudios microevolutivos. Posee una alta frecuencia de mutaciones (5 a 10 veces mayor que el DNA nuclear), no sufrerecombinación génica y tiene una transmisión unidireccional por vía materna a lo largo de las generaciones5-7. Su secuencia, que se conoce totalmente desde el año 1981, comprende 16.569 pares de bases. Posee los genes para los RNA ribosomales 12s y 16s y para 22 RNAs de transferencia, además de otras 13 secuencias que codifican para proteínas implicadas en la maquinaria energética de la célula. El DNAmitocondrial tiene muy pocas regiones no codificantes, siendo la más importante la denominada región D-loop, que constituye el trozo más largo de secuencia no codificante con un largo de 1100 pares de bases. Además, la zona del D-loop posee un alto grado de polimorfismo, y es ahí donde se han centrado la mayoría de los estudios evolutivos recientes9,10.
Diversos trabajos realizados principalmente conpoblaciones de América del Norte y Central han mostrado que la distribución de frecuencias para los cuatro haplogrupos mitocondriales no es homogénea a lo largo del continente, observándose una elevada frecuencia del haplogrupo A en América del Norte. Por otra parte el haplogrupo B presenta una elevada frecuencia en algunas regiones de Centro América así como en el altiplano. Hemos podido determinarque la frecuencia de los haplogrupos C y D aumenta progresivamente en sentido norte sur, llegando a desaparecer los haplogrupos A y B en la población yamana.
El presente trabajo tiene por objeto comparar frecuencias de haplogrupos de mtDNA de las poblaciones originarias del norte y sur de Chile con el objeto de analizar el proceso de poblamiento de nuestro territorio. Hemos incluido además unaevaluación del aporte de mtDNA indígena a la población mixta de la ciudad de Santiago con la finalidad de reconstruir la distribución de haplogrupos de mtDNA de la población indígena que dio origen a esta.
MATERIAL Y MÉTODO
Se incluyeron en este estudio 120 individuos de origen aymará del interior de Arica y 23 de origen atacameño de San Pedro de Atacama y localidades vecinas. Como en todoslos estudios que involucran poblaciones originarias estas fueron definidas en base a criterios lingüísticos, geográficos y culturales. Las muestras fueron obtenidas hace más de una década dentro del marco de proyectos antropológicos que perseguían objetivos similares.
El DNA total fue extraído a partir de linfocitos de sangre periférica congelada. La amplificación de las cuatro regionespolimórficas del mtDNA que definen los cuatro haplotipos característicos de poblaciones Amerindias se realizó mediante la técnica de PCR. Con este fin se utilizaron las parejas de partidores descritos por Moraga y col4. La reacción de amplificación fue realizada en un volumen final de 50µl, conteniendo 300 ng de DNA genómico, una unidad de Taq DNA polimerasa (Promega), pmoles de cada partidor, 200nM decada desoxinucleótido y el tampón suministrado por la empresa. Las muestras fueron procesadas bajo las siguientes condiciones de PCR: un ciclo de denaturación inicial a 95°C por 5 min. seguido por 30 ciclos de 95°C por 1 min. 55°C por 1 min y 72°C por 1 min. Finalmente un ciclo de extensión final a 72°C por 5 min. Los haplogrupos A, C y D fueron analizados por digestión con las enzimas de restricciónrespectivas, usando Hae III para el haplotipo A, Hinc II para el haplotipo C y Alu I para el haplotipo D. El resultado de la digestión con enzimas de restricción así como el producto de PCR que incluye la región intergénica V, que define el haplotipo B, fueron analizadas por electroforesis en gel de NuSieve-Agarosa al 3% (FMC BioProducts).
Técnicas. El DNA total fue extraído a partir de...
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