Genoma Completo Del Plasmodium Falciparum
Páginas: 33 (8139 palabras)
Publicado: 6 de enero de 2013
ESCUELA SUPERIOR POLITÉCNICA DEL LITORAL
FACULTAD DE INGENIERÍA MARÍTIMA, CIENCIAS BIOLÓGICAS, OCEÁNICAS Y RECURSOS NATURALES
TEMA:
Secuencia completa del genoma y expresión génica del parásito Plasmodium falciparum
ASIGNATURA:
Biología Molecular
PROFESOR:
Máster César Bedoya Pilozo
FECHA DE ENTREGA:
24 de Agosto de 2012
PERÍODO LECTIVO:
Primer Término 2012-2013GENERALIDADES
El parásito Plasmodium falciparum es el responsable de cientos de millones de casos de malaria, y mata a más de un millón de niños africanos al año. Aquí se presenta un análisis de la secuencia del genoma de P. falciparum clon 3D7. El genoma nuclear de 23 millones de pares de bases consta de 14 cromosomas, codifica aproximadamente 5.300 genes, y es el genoma más rico en Timina secuenciadohasta la fecha. Los genes implicados en la variación antigénica se concentran en las regiones subteloméricas de los cromosomas, las cuales son las regiones más alejadas de los centrómeros que poseen ADN de copia única dentro del cromosoma.
En comparación con los genomas de vida libre de microbios eucariotas, el genoma de este parásito intracelular codifica un menor número de enzimas ytransportadores, pero una gran proporción de los genes se dedican a la evasión inmune y la interacción huésped-parásito. Muchos poseedores de las proteínas codificadas están dirigidos al apicoplasto, un orgánulo implicado en el metabolismo de los ácidos grasos y de isoprenoides. La secuencia del genoma proporciona la base para futuros estudios de este organismo, y está siendo explotada en la búsqueda denuevos medicamentos y vacunas para combatir la malaria.
PAPEL EN LA MALARIA
A pesar de más de un siglo de esfuerzos para erradicar o controlar la malaria, la enfermedad sigue siendo una amenaza importante y creciente para la salud pública y el desarrollo económico de los países en las regiones tropicales y subtropicales del mundo. Aproximadamente el 40% de la población mundial vive en zonasdonde la malaria es transmitida. Hay un estimado de 300-500 millones de casos y hasta a 2,7 millones de muertes por malaria cada año. Los niveles de mortalidad son mayores en el África, donde los niños menores de 5 años de edad representan el 90% de todas las muertes debidas a la malaria. En los países con malaria endémica, las tasas anuales de crecimiento económico durante un período de 25 añosfueron del 1,5% menor que en otros países.
La malaria humana es causada por la infección con parásitos intracelulares del género Plasmodium que se transmiten por los mosquitos Anopheles. De las cuatro especies de Plasmodium que infectan a los seres humanos, el Plasmodium falciparum es el más letal. La resistencia a los medicamentos antimaláricos e insecticidas, el deterioro de la infraestructurade salud pública, los movimientos de población, la inestabilidad política y los cambios ambientales están contribuyendo a la propagación de la malaria.
Estudios recientes sugieren que el número de casos de malaria puede duplicarse en 20 años si los nuevos métodos de control no se elaboren y aplican de manera rápida y eficaz. Un esfuerzo internacional fue lanzado en 1996 para secuenciar el P.falciparum genoma con la expectativa de que la secuencia del genoma podría abrir nuevas vías para la investigación. Solamente 2 cromosomas fueron secuenciados, lo que representa 8% del genoma nuclear. Aquí se presenta un análisis de la secuencia del genoma de P. falciparum clon 3D7, incluyendo descripciones de la estructura cromosómica, el contenido de genes, la clasificación funcional de lasproteínas, el metabolismo y el transporte, y otras características de la biología del parásito.
SECUENCIACIÓN ESTRATÉGICA
La estrategia de secuenciación utilizada fue el método de la escopeta (shotgun), para determinar la secuencia del genoma de P. falciparum clon 3D7. En la secuenciación escopeta, el ADN se divide aleatoriamente en numerosos pequeños segmentos, que se secuenciaron utilizando el...
FACULTAD DE INGENIERÍA MARÍTIMA, CIENCIAS BIOLÓGICAS, OCEÁNICAS Y RECURSOS NATURALES
TEMA:
Secuencia completa del genoma y expresión génica del parásito Plasmodium falciparum
ASIGNATURA:
Biología Molecular
PROFESOR:
Máster César Bedoya Pilozo
FECHA DE ENTREGA:
24 de Agosto de 2012
PERÍODO LECTIVO:
Primer Término 2012-2013GENERALIDADES
El parásito Plasmodium falciparum es el responsable de cientos de millones de casos de malaria, y mata a más de un millón de niños africanos al año. Aquí se presenta un análisis de la secuencia del genoma de P. falciparum clon 3D7. El genoma nuclear de 23 millones de pares de bases consta de 14 cromosomas, codifica aproximadamente 5.300 genes, y es el genoma más rico en Timina secuenciadohasta la fecha. Los genes implicados en la variación antigénica se concentran en las regiones subteloméricas de los cromosomas, las cuales son las regiones más alejadas de los centrómeros que poseen ADN de copia única dentro del cromosoma.
En comparación con los genomas de vida libre de microbios eucariotas, el genoma de este parásito intracelular codifica un menor número de enzimas ytransportadores, pero una gran proporción de los genes se dedican a la evasión inmune y la interacción huésped-parásito. Muchos poseedores de las proteínas codificadas están dirigidos al apicoplasto, un orgánulo implicado en el metabolismo de los ácidos grasos y de isoprenoides. La secuencia del genoma proporciona la base para futuros estudios de este organismo, y está siendo explotada en la búsqueda denuevos medicamentos y vacunas para combatir la malaria.
PAPEL EN LA MALARIA
A pesar de más de un siglo de esfuerzos para erradicar o controlar la malaria, la enfermedad sigue siendo una amenaza importante y creciente para la salud pública y el desarrollo económico de los países en las regiones tropicales y subtropicales del mundo. Aproximadamente el 40% de la población mundial vive en zonasdonde la malaria es transmitida. Hay un estimado de 300-500 millones de casos y hasta a 2,7 millones de muertes por malaria cada año. Los niveles de mortalidad son mayores en el África, donde los niños menores de 5 años de edad representan el 90% de todas las muertes debidas a la malaria. En los países con malaria endémica, las tasas anuales de crecimiento económico durante un período de 25 añosfueron del 1,5% menor que en otros países.
La malaria humana es causada por la infección con parásitos intracelulares del género Plasmodium que se transmiten por los mosquitos Anopheles. De las cuatro especies de Plasmodium que infectan a los seres humanos, el Plasmodium falciparum es el más letal. La resistencia a los medicamentos antimaláricos e insecticidas, el deterioro de la infraestructurade salud pública, los movimientos de población, la inestabilidad política y los cambios ambientales están contribuyendo a la propagación de la malaria.
Estudios recientes sugieren que el número de casos de malaria puede duplicarse en 20 años si los nuevos métodos de control no se elaboren y aplican de manera rápida y eficaz. Un esfuerzo internacional fue lanzado en 1996 para secuenciar el P.falciparum genoma con la expectativa de que la secuencia del genoma podría abrir nuevas vías para la investigación. Solamente 2 cromosomas fueron secuenciados, lo que representa 8% del genoma nuclear. Aquí se presenta un análisis de la secuencia del genoma de P. falciparum clon 3D7, incluyendo descripciones de la estructura cromosómica, el contenido de genes, la clasificación funcional de lasproteínas, el metabolismo y el transporte, y otras características de la biología del parásito.
SECUENCIACIÓN ESTRATÉGICA
La estrategia de secuenciación utilizada fue el método de la escopeta (shotgun), para determinar la secuencia del genoma de P. falciparum clon 3D7. En la secuenciación escopeta, el ADN se divide aleatoriamente en numerosos pequeños segmentos, que se secuenciaron utilizando el...
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