Genomica Comparativa Red Regulatoria



Departamento de Biología Celular, Laboratorio de Biología del Desarrollo


Proyecto de investigación de Tésis del ______________como requisito parcial para optar al título de Licenciado en Biotecnología Genómica


TITULO PROVISIONAL DEL PROYECTO DE TESIS:
“Genómica comparativa de la Red Regulatoria Genética de la Especificación Órgano Floral en plantas Angioespermas.”


NOMBRE DEL DIRECTOR DETESIS.

NOMBRE DEL ASESOR EXTERNO


LUGAR DE TRABAJO.

FECHA DE INICIO DE LA INVESTIGACION.

DURACIÓN PROBABLE. (de 6 a 12 meses).

INTRODUCCIÓN
La estructura y la morfología de las flores se ha visto conservada a través de la evolución de las especies angioespermas. En estas plantas el meristemo de inflorescencia presenta un patrón de segmentación en cuatro verticilos que darán lugar, deforma concéntrica a los órganos característicos de la flor: sépalos, pétalos, estambres y carpelos (en este orden de fuera hacia el centro). Estos patrones se ven repetidos en las gran diversidad de especies angioespermas, en el año de 1991, Coen y Meyerowitz, desarrollan una serie de experimentos con mutantes de las plantas Arabidopsis y Antirrhinum , pudiendo así desarrollar el modelo de losgenes ABC, los cuales se presentan como genes homeóticos involucrados directamente en la arquitectura del meristemo de inflorescencia.
Dada la evidencia presentada en años posteriores, se ha determinado que dicho proceso de desarrollo debe estar regido por una Red Regulatoria Genética, donde se encuentran involucrados los genes correspondientes al modelo ABC, al igual que otros elementos involucradosen el proceso, responsables de la regulación espacio-temporal del desarrollo organo floral, denominada Red Regulatoria Genética de la Especificación Organo Floral.
El identificar los ortólogos de los genes ABC y no ABC involucrados a la FOS-GRN de Arabidopsis y poder estimar el grado de conservación de la red, en el reino de las plantas nos daría un panorama más amplio del entendimiento de laregulación de éste órgano tan importante para las plantas.
La conservación de los genes ABC y no ABC responsables de la Especifcación Organo Floral en Arabidopsis, dentro de las distintas especies de plantas fanerógamas, con ayuda de las herramientas bioinformáticas nos sería capaz de definir de manera cualitativa el grado de conservación de la red.
El reciente avance en la era post-genómica, hapermitido recolectar datos de los genomas de las plantas fanerógamas que utilizaremos en éste estudio, ésta información nos será útil para comparar con los elementos genéticos de la FOS-GRN de Arabidopsis e identificar los genes ortólogos correspondientes a las especies de estudio.
De encontrarse presencia y/o ausencia de estos genes, podemos dar pie a estudio de evolución molecular para identificarlos patrones de conservación que presenta éste modulo en particular o bien se podrían replantear las bases dinámicas de las redes regulatorias del desarrollo floral.
HIPOTESIS DE TRABAJO
Los genes involucrados en la Red Regulatoria Genética de la Especificación Órgano Floral de Arabidopsis thaliana, se conservan filogenética y molecularmente en las especies de plantas fanerógamas.OBJETIVOS
General
Identificar los genes ortólogos correspondientes a la FOS-GRN de Arabidopsis thaliana en las distintas especies de plantas con flor que han sido secuenciadas y anotadas hasta el momento.
Específicos
Determinar los motivos o dominios funcionales, de los módulos ortológicos identificados.
Identificar posibles parálogos.
Analizar ontológicamente los componentes y relacionarlos consu actividad / relevancia en la FOS-GRN
Crear un catálogo de los componentes de la red estudiada.
ANTECEDENTES
La arquitectura básica de la flor se encuentra conservada en la mayoría de las plantas angioespermas (Drinnan et al., 1994), siendo Arabidopsis thaliana la especie modelo más estudiada en plantas angioespermas.
La arquitectura típica de la flor, presente en arabidopsis y en la mayoría de...