Hematología

Secuenciación masiva en paralelo ha reducido el coste y el aumento del rendimiento de la secuenciación genómica en más de tres órdenes de magnitud, y parece probable que los costos bajarán y el rendimiento mejorará aún más en los próximos años. El uso clínico de secuenciación masiva en paralelo proporcionará una manera de identificar la causa de muchas enfermedades de etiología desconocidamediante el cribado simultáneo de miles de loci para las mutaciones patógenas y mediante la secuenciación de muestras biológicas para las firmas genómicas de los nuevos agentes infecciosos. Además de proporcionar estas totalmente nuevas capacidades de diagnóstico, secuenciación masivamente paralelo también puede sustituir las matrices y secuenciación de Sanger en aplicaciones clínicas en las que seestán utilizando actualmente.
Uso clínico rutinario de secuenciación masiva en paralelo requerirá una mayor precisión, mejores formas de seleccionar subconjuntos genómicas de interés, y las mejoras en la funcionalidad, velocidad y facilidad de uso del software de análisis de datos. Además, se necesitarán mejoras sustanciales en la infraestructura de laboratorio equipo, almacenamiento de datos, y lacapacidad de transferencia de datos para manejar los conjuntos de datos extremadamente grandes producidas. Los médicos y personal de laboratorio requerirán capacitación para utilizar los datos de la secuencia de manera eficaz, y tendrán que ser desarrolladas para lidiar con el descubrimiento incidental de mutaciones patogénicas y variantes de significado clínico incierto métodosapropiados. Massively secuenciación paralela tiene el potencial de transformar la práctica de la genética médica y campos relacionados, pero la gran cantidad de datos genómicos personales producidos aumentará la responsabilidad de los genetistas para asegurarse de que la información obtenida se utiliza de una manera médicamente y socialmente responsable.
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Texto Principal
Introducción
La secuenciación delADN fue descrita por primera vez por Maxim y Gilbert 1 y Sanger et al. en 1977. 2mejoras posteriores en el método de Sanger han aumentado la eficacia y la precisión más de tres órdenes de magnitud. En cada paso, más sofisticados instrumentos de secuenciación de ADN, los programas y la bioinformática han proporcionado una mayor automatización y un mayor rendimiento. Varios métodos de secuenciaciónmasiva en paralelo se han convertido en disponible en el último par de años, lo que permite la producción a gran escala de la secuencia genómica, y el número de genomas humanos secuenciados con tanta instrumentación está aumentando rápidamente. 3-6
A medida que el costo de la secuenciación masiva en paralelo cae, se hace factible para los laboratorios más pequeños a adoptar esta tecnología, aunqueel hacerlo implica costos iniciales sustanciales. Estos incluyen no sólo las máquinas de secuenciación masivamente paralelo mismos, sino también los costos asociados con el almacenamiento y análisis de datos. Secuenciación masiva en paralelo ha tenido poco impacto en el diagnóstico clínico hasta la fecha, pero con la promesa de los $ 1000 del genoma a mano, 7 parece sólo cuestión de tiempo antesde secuenciación masiva en paralelo se hace rutinariamente disponible en laboratorios clínicos.
Massively secuenciación paralela permitirá la detección simultánea de mutaciones en cientos de loci en los trastornos genéticamente heterogéneas, la detección del genoma completo de nuevas mutaciones, y la detección basada en la secuencia de nuevos agentes patógenos que causan enfermedadeshumanas. Además, la secuenciación masivamente paralelo permitirá la aplicación clínica de nuestro conocimiento en expansión de la farmacogenética, la genética del cáncer, la epigenética y los rasgos complejos. Como con cualquier nueva prueba clínica, análisis de utilidad clínica tendrá que ser llevado a cabo y las normas y directrices claras tendrá que ser puesto en marcha antes de la secuenciación masiva...