Ing. en Biotecnología
Páginas: 2 (496 palabras)
Publicado: 5 de mayo de 2014
Alejandro Guerra Benavides 1034420
Ing. Genética
MC. Juan Gerardo Cantú
Tarea Biocomputo/Bioinformática
Accesa el sitio del “genebank” (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) ycontesta las siguientes preguntas:
a. ¿Cuántas secuencias de nucleótidos se estima que hay en la base de datos a la fecha?
Hasta Agosto del 2013, la base de datos cuenta con 167, 295,840 secuencias denucleótidos.
b. ¿Qué significan las siglas BLAST?
Las siglas representan Basic Local Alignment Search Tool que se encuentra en el portal de NCBI.
c. ¿Qué es el formato FASTA?
El formato FASTAmanipula y analiza secuencias de nucleótidos o péptidos usando herramientas de procesamiento de textos y de lenguajes de scripting, usando códigos o letras este formato representa toda la cadena debases nitrogenadas.
d. Pon un ejemplo de una secuencia con formato FASTA
CCTCTCGGAGCTGGAAATGCAGCTATTGAGATCTTCGAATGCTGCGGAGCTGGAGGCGGA
GGCAGCTGGGGAGGTCCGAGCGATGTGACCAGGCCGCCATCGCTCGTCTCTTCCTCTCTCCTGCCGCCTCCTGTGTCGAAAATAACTTTTTTAGTCTAAAGAAAGAAAGACAAAAGTAGT
CGTCCGCCCCTCACGCCCTCTCTTCCTCTCAGCCTTCCGCCCGGTGAGGAAGCCCGGGGT
GGCTGCTCCGCCGTCGGGGCCGCGCCGCCGAGCCCCAGCGCCCCGGGCCGCCCCCGCACGCCGCCCCCATGCATCCCTTCTACACCCGGGCCGCCACCATGATAGGCGAGATCGCCGCCG
CCGTGTCCTTCATCTCCAAGTTTCTCCGCACCAAGGGGCTGACGAGCGAGCGACAGCTGC
AGACCTTCAGCCAGAGCCTGCAGGAGCTGCTGGCAGAACATTATAAACATCACTGGTTCCCAGAAAAGCCATGCAAGGGATCGGGTTACCGTTGTATTCGCATCAACCATAAAATGGATC
2) Localiza el gen de la Insulina humana en el “genebank” (Human insulin gene, complete cds J00265.1)
1.
a. Colócalo en formato FASTA (puedes utilizar laherramienta cortar/pegar)
>gi|186429|gb|J00265.1|HUMINS01 Human insulin gene, complete cds CTCGAGGGGCCTAGACATTGCCCTCCAGAGAGAGCACCCAACACCCTCCAGGCTTGACCG-
GCCAGGGTGTCCCCTTCCTACCTTGGAGAGAGCAGCCCCAGGGCATCCTGCAGGGGGTGCTGGGACACCA-
GCTGGCCTTC AAGGTCTCTGCCTCCCTCCAGCCACCCCACTACACGCTGCTGGGATCCTGGATCTCAGCT-
CCCTGGCCGA CAACACTGGCAAACTCCTACTCATCCACGAAGGCCCTCCTGGGCATGGTGGTCCTTCCCA-
GCCTGGCAGT...
Ing. Genética
MC. Juan Gerardo Cantú
Tarea Biocomputo/Bioinformática
Accesa el sitio del “genebank” (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) ycontesta las siguientes preguntas:
a. ¿Cuántas secuencias de nucleótidos se estima que hay en la base de datos a la fecha?
Hasta Agosto del 2013, la base de datos cuenta con 167, 295,840 secuencias denucleótidos.
b. ¿Qué significan las siglas BLAST?
Las siglas representan Basic Local Alignment Search Tool que se encuentra en el portal de NCBI.
c. ¿Qué es el formato FASTA?
El formato FASTAmanipula y analiza secuencias de nucleótidos o péptidos usando herramientas de procesamiento de textos y de lenguajes de scripting, usando códigos o letras este formato representa toda la cadena debases nitrogenadas.
d. Pon un ejemplo de una secuencia con formato FASTA
CCTCTCGGAGCTGGAAATGCAGCTATTGAGATCTTCGAATGCTGCGGAGCTGGAGGCGGA
GGCAGCTGGGGAGGTCCGAGCGATGTGACCAGGCCGCCATCGCTCGTCTCTTCCTCTCTCCTGCCGCCTCCTGTGTCGAAAATAACTTTTTTAGTCTAAAGAAAGAAAGACAAAAGTAGT
CGTCCGCCCCTCACGCCCTCTCTTCCTCTCAGCCTTCCGCCCGGTGAGGAAGCCCGGGGT
GGCTGCTCCGCCGTCGGGGCCGCGCCGCCGAGCCCCAGCGCCCCGGGCCGCCCCCGCACGCCGCCCCCATGCATCCCTTCTACACCCGGGCCGCCACCATGATAGGCGAGATCGCCGCCG
CCGTGTCCTTCATCTCCAAGTTTCTCCGCACCAAGGGGCTGACGAGCGAGCGACAGCTGC
AGACCTTCAGCCAGAGCCTGCAGGAGCTGCTGGCAGAACATTATAAACATCACTGGTTCCCAGAAAAGCCATGCAAGGGATCGGGTTACCGTTGTATTCGCATCAACCATAAAATGGATC
2) Localiza el gen de la Insulina humana en el “genebank” (Human insulin gene, complete cds J00265.1)
1.
a. Colócalo en formato FASTA (puedes utilizar laherramienta cortar/pegar)
>gi|186429|gb|J00265.1|HUMINS01 Human insulin gene, complete cds CTCGAGGGGCCTAGACATTGCCCTCCAGAGAGAGCACCCAACACCCTCCAGGCTTGACCG-
GCCAGGGTGTCCCCTTCCTACCTTGGAGAGAGCAGCCCCAGGGCATCCTGCAGGGGGTGCTGGGACACCA-
GCTGGCCTTC AAGGTCTCTGCCTCCCTCCAGCCACCCCACTACACGCTGCTGGGATCCTGGATCTCAGCT-
CCCTGGCCGA CAACACTGGCAAACTCCTACTCATCCACGAAGGCCCTCCTGGGCATGGTGGTCCTTCCCA-
GCCTGGCAGT...
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