ingeniera de la proteina

Ingeniería de proteínas
La Ingeniería de Proteínas es una rama emergente de la ingeniería. Aplica conocimientos de matemática, economía y biología molecular al diseño de proteínas. La ingeniería deproteínas opera de forma iterativa, siguiendo un proceso cíclico que alterna etapas en las que se planean y ejecutan los cambios a realizar con otras en las que se evalúa el resultado de los mismos. Aeste proceso se le ha denominado ciclo de diseño(1)
Archivo:ProteinDesignCycle.jpg
Pasos seguidos en la ingeniería de proteínas
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Existen dos métodos para el diseño de proteínas: el diseño racional(rational design) y la evolución dirigida.
En el "diseño racional" se introducen cambios en ciertos aminoácidos mediante mutagenesis dirigida, basados en la hipótesis que algunos cambios específicoscausarán el efecto funcional buscado. Existen ocasiones que dichos cambios se dan combinado dominios o motivos estructurales de distintas proteínas, generando una proteína híbrida o quimera. Es unmétodo sencillo y barato. En la evolución dirigida se introducen mutaciones aleatorias en la proteína bajo estudio y se seleccionan solo aquellas variantes que presentan las propiedades deseadas.Generalmente se emplean dos técnicas de biología molecular para realizar lamutagénesis aleatoria de genes aislados. Una es la conocida como “error-prone PCR”consistente en la amplificación mediante PCR(reacción en cadena de la polimerasa) del gen que codifica la proteína de interés en condiciones que inducen a la DNA-polimerasa a cometer errores. El otro procedimiento es el “DNA-shuffling”, que consiste enla fragmentación de la secuencia que se desea mutagenizar mediante digestión conDNAsa, seguida de un reensamblaje de la misma mediante PCR. Varias rondas de mutación y selección dan lugar a unacolección de proteínas modificadas que presentan las características deseadas, sin embargo algunos ensayos funcionales pueden ser considerablemente complejos, y hallar la proteína mutante que contiene...