Jose

She said (that) she could be there by noon.
--> Ella dijo que (ella) PODRIA estar allá al medio día.
En este caso, estás usando could, pero en reported speech, así que estamos complicando mucholas cosas, porque en realidad desconocemos cuáles fueron las palabras originales de la persona, por lo tanto no sabemos con certeza como traduciría el could.
Si la persona dijo “I can be here bynoon”, estaba expresando habilidad, y al reportar se pasa el can a could.
Si la persona dijo “I could be here by noon”, estaba expresando posibilidad futura, y al reportar el could se quedó en could, no sepasa a nada.

Yo creo que hacés análisis demasiado exhaustivo que no te está conduciendo a nada práctico, porque te rompés la cabeza pero en definitiva terminás más confundido. En la práctica, enlo cotidiano, el uso de could es algo más simple.
Empezando con CAN, tenemos que saber que así en su forma más simple, significa tanto habilidad como permiso.
I can swim. Yo sé nadar, yo puedonadar, porque sé hacerlo. Habilidad.
I can use a calculator. Sé usar una calculadora, pero también puedo usarla porque tengo permiso. Ambas cosas, depende del contexto.

En el caso negativo, las cosasson distintas.
I can’t swim. No sé nadar. No sé hacerlo. No hay habilidad.
I can’t swim. No puedo nadar pues está prohibido, no hay permiso, o no me permiten hacerlo.

Usando could, se refiereal pasado de can, cuando hablamos de habilidad.
I could speak English when I was 7.
A los siete años yo sabía hablar inglés. Habilidad. Sabía o podía, para el caso es lo mismo. Aquí estamos hablandode pasado.

Could puede usarse con significado futuro, en una función del modal que es especulación, probabilidad, no hay certeza.
I could go to Europe next summer…. Podría ir sí, pero no sé… Osea, tengo el dinero, tengo el tiempo, pero aún no lo sé. Podría ser… existe la posibilidad y es en el futuro.

Aquí podría utilizarse también may o might en lugar de could, y el significado es...