La clonación y secuenciación de la serie explorer - los ocho módulos

Tabla de contenidos

Actividad Diagrama de flujo

Introducción y ajuste del curso

Objetivos específicos que cumple este proyecto

Cronograma para el curso de laboratorio

Laboratorio Sesión 1

Laboratorio Sesión 2

Laboratorio Sesión 3

Laboratorio sesión 4 y 5

Laboratorio Sesión 6

Laboratorio Sesión 7

LaboratorioSesión 8

Módulos equipos y tabla de requisitos

IMFORMACION GENERAL

Bio-Rad Laboratorios dará a conocer la clonación y secuenciación de la serie Explorer en el otoño 2008. La intención de esta guía de planeación es proporcionar una visión general a la totalidad de los estudiantes del proyecto de investigación, incluyendo detalles de los plazos, los materiales incluidos, y equipo requeridospara que los instructores puedan preparar su plan de estudios y estimación presupuestaria requeridos con antelación. Estas son estimaciones basadas en información actualmente disponible, y pueden cambiar en la versión final de la serie de laboratorio.
La clonación y secuenciación de la serie Explorer está integrado por ocho módulos de laboratorio que pueden utilizarse por separado o en serie para unproyecto semana entera 6-8. Debido a la naturaleza modular de la serie, algunos componentes se utilizan en combinación con otros módulos para un flujo de trabajo continuo.

La clonación y secuenciación de la serie Explorer - Los ocho módulos
166-5000EDU, el precio estimado de $ 1.400
Está disponible en 12 estaciones de trabajo de los estudiantes
La serie incluye:
166-5005EDU Nucleic AcidExtracción Módulo
166-5010EDU GAPDH PCR Módulo
166-0451EDU Electroforesis Módulo
732-6300EDU PCR Kleen ™ Giro Módulo Purificación
166-5015EDU unión y transformación del módulo
166-5020EDU microbiana Módulo de cultivo
732-6400EDU Aurum ™ Módulo de purificación del plásmido Mini
166-5025EDU Secuenciación y Bio informática Módulo
166-5001EDU Curriculum CD, que incluye la Guía del Instructor, defondo de información, preguntas de los estudiantes de enfoque, Guías rápidas gráficas

Resumen
Las técnicas de clonación de genes son un tema común en la mayoría de los cursos de biología molecular, pero ofrecer a los estudiantes la experiencia práctica es lo más difícil. El objetivo de este proyecto es lograr con estudiantes aislar, secuenciar y caracterizar un gen fundamental de laglucólisis (GAPDH, el gen de la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa o GAPDH) de una especie vegetal, o de la variedad, con gen del cual no se haya publicado previamente su secuencia. Además de las técnicas de laboratorio húmedo (por ejemplo, extracción de ADN, reacción en cadena de la polimerasa (PCR), la ligadura, la transformación, restricción de la digestión), los estudiantes obtienen experienciaen el análisis bioinformático de sus clones únicos. Esto incluye búsquedas BLAST, la identificación de los intrones o exones, la construcción contig, y el conocimiento bioinformático de diferentes bases de datos. Estos resultados son publicables en la base de datos NCBI GenBank.

Curso de Introducción y ajuste
En este proyecto los estudiantes aislar (clon) una porción principal del gen GAPDH.Este gen es considerado como un gen de mantenimiento debido a que codifica una enzima que cataliza en un importante paso de la glicólisis, que es la etapa de respiración que se produce en todas las células eucariotas. Por lo tanto, este gen está altamente conservado y se encuentra en el genoma de todas las plantas.
GAPDH es una enzima crucial para todos los animales, protistas, hongos, bacterias yplantas. Por lo tanto, hay muchas oportunidades para establecer conexiones entre los aspectos moleculares de GAPDH y sus importancia biomédica y evolutiva. En efecto, en Arabidopsis hay siete genes muy similares GAPDH. Esta práctica de laboratorio se dirige a una subfamilia de estos genes - GAPC y GAPC2 – y los estudiantes podrán clonar uno o ambos de estos genes en el curso de su experimento....