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Carotenoides: pigmentos de coloración variada dentro de la gama de los amarillos, pardos, naranjas. El carotenoide es un tipo de antioxidante y de provitamina. No son exclusivos de las algas yaparecen tanto en vegetales como en animales. Se diferencian 2 tipos: los carotenos y las xantofilas.
Caroteno. Sustancia amarilla, roja o naranja del grupo carotenoide con función antioxidante.Algunos carotenoides se transforman en vitamina A en el cuerpo y algunos están en estudio para prevenir el cáncer.
Xantofila: pigmento accesorio, derivado de los carotenos, responsables de lascoloraciones amarillas y anaranjadas.
Luteína: es un compuesto químico perteneciente al grupo de las xantófilas, pigmento de color amarillo, encargada de proteger al alga de la radiaciónsolar.
La fucoxantina es un tipo de carotenoide de color marrón o pardo que se encuentra en algunas algas comestibles, como el wakame y el hijiki.
Ficobilinas: pigmentos de color rojo (ficoeritrina)o azul (ficocianina) exclusivos de las algas.
Ficocianina: es un compuesto que se encuentra en las algas azul verdosas. Es el pigmento ficobilínico azul libre de metal en una cromoproteínaconjugada de algas azules-verdosas. Funciona como sustancia que absorbe la luz, junto con la clorofila, absorbe la luz amarilla y roja, a veces fluorescencia.
Ficoeritrina: Es el pigmentoficobílico rojo libre de metal en una cromoproteína conjugada de las algas rojas. Funciona como sustancia que absorbe la luz junto con la clorofila.
Clorofilas: pigmentos de color verde. No son exclusivosde las algas aparecen en todas las plantas. En la actualidad, se conocen varios tipos siendo las más frecuentes la clorofila a y la b.


Función de los pigmentos: absorber longitudes deondas. Ejemplo: la clorofila absorbe todos los colores menos el verde. Y así, sucede con los demás, por lo menos la ficoeritrina absorbe todos los colores menos el rojo, que es el que refleja.