Manual_Garp


DesktopGarp: Manual de usuario

By http://www.nhm.ku.edu/desktopgarp

~ (traducido por Elisa Liras (eliras@ual.es) ~


Introducción

DesktopGarp es un software para realizar investigación en biodiversidad y ecología que permite al usuario predecir y analizar la distribución de especies.
DesktopGarp es la versión de “escritorio” del algoritmo GARP. El acrónimo viene del inglésGenetic Algorithm for Rule-set Production (algoritmo genético basado en reglas). GARP está desarrollado originalmente por David Stockwell en el ERIN Unit of Environment Australia y mejorado en San Diego Supercomputer Center. Una versión interactiva del algoritmo, implementada vía web, se encuentra en la página web de Biodiversity Species Workshop.

GARP es un algoritmo genético que crea un modelo denicho ecológico para una especie que representa las condiciones ambientales donde dicha especie sería capaz de mantener su población. GARP utiliza como entrada un conjunto de localidades (puntos) donde se sabe que la especie está presente y un grupo de coberturas geográficas que representan los parámetros ambientales que pueden, potencialmente, limitar la capacidad de supervivencia de la especie.GARP trata, de forma interactiva, de encontrar las correlaciones entre las presencias y ausencias de la especie con los parámetros ambientales, utilizando una serie de reglas diferentes. Cada tipo de regla implementa un método diferente para construir los modelos de predicción de la especie. Actualmente hay 4 tipos de reglas implementadas: atómica, regresión logística, envoltura bioclimática ynegación de la envoltura bioclimática. Para una descripción detallada del algoritmo GARP, vaya al documento escrito por David Stockwell “GARP Technical Manual and Users Guide”.

Requerimientos del sistema

La configuración mínima del sistema para ejecutar DesktopGarp es:

Sistema operativo basado en Intel/Pentium
Windows 98 SE (Second Edition), Edition (ME), NT 4, 2000 (todas lasversiones) y XP (todas las versiones);
64 MB de memoria RAM;
100 MB en el disco duro.

Adicionalmente, la configuración del sistema recomendada, basándonos en el tamaño medio de los experimentos, es:

256 MB o más memoria RAM – Cuanto más mejor: el tamaño óptimo de memoria RAM depende en cómo de voluminosas sean sus bases de datos (número de píxeles), el número de coberturas que usted tiene y elnúmero de “vueltas” del modelo necesarias para su experimento. La cantidad de memoria se puede estimar según: (#píxeles por cobertura) X (#coberturas en la base de datos) X (10KB X # número de vueltas del modelo)
40GB de disco duro, preferiblemente un disco rápido SCSI. El resultado del modelo puede ser bastante numeroso y voluminoso, dependiendo de los parámetros de su experimento.
MicrosoftExcel 97, 2000 o XP – para procesar los datos de entrada y los resultados.
ESRI ArcView con la extensión Spatial Analyst – para crear bases de datos adecuadas a sus necesidades y para analizar los mapas de distribución resultantes.
Máquinas con multi-proceso NO mejorarán la ejecución de un experimento único, ya que DesktopGarp es totalmente secuencial (no paralelo) en la actualidad. La gananciasolo se apreciará si se están ejecutando 2 o más experimentos al mismo tiempo (cada experimento utilizará un procesador).

Instalación

Ejecute el archive de instalación descargado desde nuestra página web. Sitúe DesktopGarpSetup_1_1_6.exe utilizando Windows Explorer y haga doble click sobre él. Si se elige abrir el archivo directamente desde la página web, el proceso de instalación comenzaráinmediatamente una vez que la descarga se haya completado.

Cuando comience el proceso de instalación, siga las instrucciones que aparezcan en la pantalla.

Durante el proceso de instalación, se le ofrecerá instalar otro software adicional llamado Microsoft XML Parser. Lea y acepte el acuerdo de licencia si está de acuerdo con él, y siga los pasos que aparezcan en pantalla. Tenga en cuenta...