Marcadores moleculares

Marcadores moleculares
Marcador | Características | Ventajas | Desventajas | Identificacion |
Isoenzimas | Presentan varias formas alélicas, conocidas como aloenzimas.En su mayoría son selectivamente neutras y se utilizan como marcadores hereditarios para cuantificar las frecuencias alélicas y genotípicas de los individuos.Su aplicación está dirigida a la cuantificación de heterocigosis,diversidad genética, diferenciación genética y otras medidas de variación genética intra e interpoblacional.Ayuda a evaluar aspectos de biología evolutiva como los sistemas de reproducción y patrones de fecundación cruzada, relaciones entre fenotipo y ambiente, filogenias, endemismo,diversidad en plantas clonales yapomícticas e interacciones planta-animal. | Son expresadas codominantemente, losgenotipos homócigos y heterócigos pueden ser distinguidos con mucha precisión.Muchos de sus loci son polimórficos.La técnica es barata en comparación con otras. | Revelan poca variación.La técnica es muy laboriosa, requiere de mucho tiempo y entrenamiento y, sobre todo, es poco reproducible entre laboratorios. | Para un locus dado, el número de bandas varía entre individuos homócigos y heterócigosy también varía en función de la estructura cuaternaria de la enzima; si es monomérica los individuos homócigos representan una sola banda y los heterócigos presentan dos bandas; si es una enzima dimérica, los heterócigos presentan tres bandas (dos homodímeros de los padres y un producto adicional de movilidad intermedia); en las enzimas tetraméricas se observan 5 bandas en los individuosheterócigos |
RAPDs(Polimorfismos de ADN amplificados al azar) | Amplifican aleatoriamente segmentos de ADN en una gran variedad de especies.Se basan en la probabilidad estadística de que se presenten sitios complementarios al oligonucleótido de 10 pares de bases (pb) a lo largo del genoma. El polimorfismo de las bandas entre los individuos se debe a cambios en la secuencia de los nucleótidos en lossitios de acoplamiento del oligonucleótido y por inserción o deleción de los fragmentos en estos sitios.Son dominantes, es decir, no pueden discernir los homócigos dominantes de los heterócigos para un segmento,por lo que la estimación de las frecuencias alélicas se debe hacer de manera indirecta, asumiendo equilibrio de HardyWeinberg.Utiles en la elaboración de mapas genéticos, en el estudio deparentesco y en el análisis de la estructura poblacional.Una de sus mejores aplicaciones es la identificación genética de individuos, que incluye casos de clones, híbridos somáticos y mutantes. Otra aplicación paralela es la detección de uniformidad genética con un marcador eficiente y rápido. | Amplifican regiones tanto codificantes del ADN como las no codificantes y revelan niveles de variaciónmás altos que los RFLPs e isoenzimas.Técnica relativamente fácil que no necesita conocimiento previo de la secuencia de ADN no requiere la construcción o el mantenimiento de una ibrería genómica.El número de loci que puede ser examinado es ilimitado y no requiere pruebas radiactivas | Presencia de bandas “erróneas” (artefactos).La reproducibilidad de los resultados y la comigración de bandas.Muchosde los alelos raros presentes en las poblaciones estudiadas con RAPDs no son detectados o pueden ser mal interpretadosComo los loci son dominantes, los RAPDs dan menos información genética por locus que los marcadores codominantes | Al analizar los datos obtenidos con RAPDs se deben tener en cuenta dos supuestos: 1) cada uno de los marcadores representa un locus mendeliano en el cual el marcadorvisible, el alelo dominante, está en equilibrio de HardyWeinberg con un alelo recesivo y 2) los alelos marcados para diferentes loci no migran a la misma posición en el gel. |
Microsatélites (secuencias simples repetidas SSRs) | Secuencias de ADN formadas de 1 a 4 pares de bases.Estos loci se encuentran en regiones codificantes y no codificantes del ADN.Han sido utilizados fundamentalmente...