marcadores tumorales

Fisiogenética Vegetal
USO DE MARCADORES MOLECULARES,
aplicaciones y ejemplos

Cecilia Baginsky

- Tradicionalmente los marcadores moleculares utilizados
en estudios genéticos y de mejoramiento eran aquellos
controlados por genes asociados a caracteres
morfológicos,
en
general
fenotipos
de
fácil
identificación

-La mejora genética dependía de:
- variabilidad genética,
-heredabilidad del carácter que se quería aislar,
- eficacia en la intensidad de la selección aplicada,
- tiempo necesario para realizar un ciclo de selección.

Problemas:

Desconocimiento
Número y efecto de los
genes implicados en la
expresión de un carácter

Localización de estos genes

Función fisiológica

MARCADORES MOLECULARES
Definición:
Definición
Son todos aquellas moléculas(proteínas o ADN) que se
pueden identificar y caracterizar para definir un
genotipo determinado. Muchos de ellos permiten la
asociación de genotipos con fenotipos específicos.
Definición
Es cualquier fenotipo molecular, oriundo de la expresión
de un gen, como es el caso de las isoenzimas o de
segmentos específicos de DNA (correpondiente a
regiones expresadas o no del genoma), que puede serdetectado y su herencia monitoreada (Ferreira y
Gattapaglia, 1998)

Polimorfismos de DNA
- Variaciones, más o menos complejas en la secuencia de
ADN.
- Varios eventos pueden producir poliformismo:
- Mutuaciones puntuales
- Inserciones o delecciones
- Nuevos arreglos
- Un marcador es polimorfico cuando existen distintas
variantes o “alelos” del marcador dentro de la
población bajoestudio

MARCADORES MOLECULARES
PROTEINAS
• Isoenzimas
ADN
• RFLP (Random Fragments Length Polimorphism)
• PCR- RAPDs (Random Amplified Polimorphic DNA)
• AFLPs (Amplified Fragment Length Polimorphism)
• Minisatélites o VNTR
• Microsatélites o SSR (Simple Sequence Repeats)

CLASIFICACIÓN DE LOS MARCADORES
MOLECULARES
• Basados en electroforesis de proteínas (Alozímas).

• Basados enhibridación de sondas “Southern Blot” (RFLP
y MINIsatelites o VNTR).
• Basados en PCR (PCR-RFLP, RAPD, AFLP, SSR o
MICROsatelites).

CONCEPTOS CLAVES DE LA GENÉTICA
GENOTIPO
ADN

5’

3’

genes

ARNm

proteínas
células
FENOTIPO
+
AMBIENTE

organismo

tejidos,
órganos

BASE MOLECULAR DE LA

A

A

a

a

GENETICA MENDELIANA
Genealogía para un gen
recesivo
¼½

¼

A

A

a

A

a

a

mutación que
produce una
proteina corta

E L E C T R O F O R E S I S

Marcadores Moleculares en
base a electroforésis de
proteínas
ISOENZIMAS

ISOENZIMAS
Definición:
Grupo de múltiples formas moleculares de la misma
enzima presentes en una especie, como resultado de la
presencia de más de un gen codificado para cada una
de las enzimas(Moss, 1982)
Desempeñan la misma actividad catalítica pero pueden
tener diferentes propiedades cinéticas. Su diferente
estructura y carga eléctrica hace que presenten
distinta movilidad electroforética en geles de almidón
Modo de herencia CODOMINANTE.

Se corta el gel en
láminas delgadas

Tinción enzimática específica
para distintas láminas

Shikimato
Ácido
ShikímicoDeshidrogenasa

NADP +

3 Deshidro
Shikimato

Precipitado
Azul

NADPH + MTT

Variantes isoenzimaticas de la enzima Shikimato deshidrogenada
SKHD en poblaciones de arroz silvestre brasileñas.

Ventajas de las isoenzimas
•

Simplicidad

•

Mínima cantidad de material en estudio

•

Altamente reproducible

•

Bajo costo

•

Codominante, lo que permite hacer
comparacionesentre especies, poblaciones de
una misma especie y detectar la presencia de
híbridos

Deventajas de las isoenzimas
•

No es capaz de detectar suficiente
polimorfismo al presentar pocos alelos por
locus, especialmente cuando la base genética es
estrecha (entre variedades o especies
próximas)

•

Pueden no reflejar los cambios genéticos que
ocurren en el DNA, además sólo un set de...