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La zona del Márques, tequisquiapan, Pedro Escobedo, san Juan del Rio y Ezequiel montes son zonas secas.
La precipitación media estatal es de 570 mm anuales, las lluvias sepresentan en verano en los meses de junio a septiembre.


AGUA
Ríos
Moctezuma
Santa María
San Juan
Extóraz
Ayutla
El Pueblito
Jalpan
Colón
Victoria
Las ZúñigasYerbabuena
Los Amoles
El Macho
Conca
Otros cuerpos de agua, las presas
Zimapán
Constitución de 1917
San Ildefonso
Centenario
Santa Catarina
La Llave (El DivinoRedentor)
Jalpan
La Soledad
El Capulín de Amealco
El Carmen
San Pedro Huimilpan
Flora y fauna
Flora
Predominan los matorrales que se ubican en la parte central del estado; lesiguen en importancia los bosques de coníferas y encinos que se ubican en las zonas altas del norte y las selvas secas en las partes bajas del centro y norte de la entidad. Lospastizales se localizan en las áreas cercanas a los bosques y selvas. La superficie agrícola ocupa 30% del total del territorio, que ha desplazado a la vegetación original delsur.
FUENTE: CONABIO
Fauna
En el matorral: rata y ratón de campo, ardilla, murciélago, zorrillo, coyote, huilota y lagartija-escamosa. En los bosques de coníferas y encinos:pájaro carpintero, cotorra serrana, ardilla vola¬dora, musaraña, venado cola blanca, zorra gris, cacomixtle, tlacuache, lince, comadreja, tuza, mapache y xenosaurio. Animal enpeligro de extinción: armadillo.
Áreas naturales protegidas
Reservas de la biosfera
Sierra Gorda
Parques nacionales
Cerro de las Campanas y El Cimatario
Área deprotección de recursos naturales
Zona protectora forestal de los terrenos comprendidos dentro de cuencas hidrográficas 
de los ríos San Ildefonso, Ñado, Aculco y Arroyo Zarco