medicina

MEDICINA GENOMICA EN MEXICO Y SU DESARROLLO
México está desarrollando las bases para la medicina genómica con el fin de mejorar el cuidado de la salud de su población. El estudio amplio de ladiversidad genética y las estructuras de desequilibrio de ligamiento de diferentes poblaciones, ha hecho posible el desarrollo de estrategias de captura o “tagging” de variabilidad genética, así como deimputación de genotipos, para evaluar integralmente la variabilidad común en estudios de asociación en enfermedades comunes. Nosotros evaluamos el beneficio de un mapa de haplotipos mexicano para laidentificación de genes relacionados a enfermedades comunes en mexicanos. Con este objetivo se caracterizaron la diversidad genética, los patrones de LD y la proporción de haplotipos compartidosutilizando datos genómicos de mestizos mexicanos provenientes de regiones con diferente historia de mestizaje y distintas dinámicas poblacionales. Se han colectado 300 muestras de sangre de individuosno emparentados autodefinidos como mestizos y de 30 amerindios zapotecas sin parentesco familiar en primer grado. Se obtuvieron muestras anónimas en siete estados de México: Guanajuato. Guerrero,Sonora, Veracruz, Yucatán, Zacatecas, y Oaxaca (ZAP). Este estudio fue aprobado por los Comités Científico, Ético y de Bioseguridad del Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN). Se aplicó unproceso ad-hoc para la consulta y participación comunitaria que incluyó tanto a autoridades gubernamentales estatales y autoridades universitarias y sanitarias, como a miembros de la comunidad local. Serealizó la extracción de DNA genómico de sangre periférica (Qiagen). La genotipificación se realizó conforme al protocolo del microarreglo Affymetrix 100K y en total, 99,953 SNPs cumplieron con loscriterios de control de calidad para todas las poblaciones analizadas. El ordenamiento o “phasing” de nuestros genotipos mexicanos se realizó con fastPhase v1.1.4 (45). Existe un portal de internet...