Medico
Microarreglos de ADN y sus aplicaciones en investigaciones biomédicas
Carlos Vallin Plous
Laboratorio de Genética, Centro de Química Farmacéutica, Avenida 21 y Calle 200, Atabey, Playa, Ciudad de La Habana, Código Postal 11600, Cuba. Correo electrónico: val@infomed.sld.cu
Recibido: 20 de enero de 2006.
Aceptado: 24 de marzo de2007.
Palabras clave: microarreglo de ADN, genes, hibridización, expresión. Key words: DNA arrays, genes, hybridization, expression.
RESUMEN. El objetivo del presente trabajo consiste en realizar una actualización
de los últimos desarrollos llevados a cabo en la tecnología relacionada con los microarreglos de ADN y su aplicación en la medicina. Los microarreglos de ADN surgen de la necesidadde analizar la cantidad de información procedente de los grandes proyectos de secuenciación de genomas. Los “chips” o microarreglos de ADN son una serie de sondas de ADN unidas a un soporte sólido en una disposición regular y prefijada. El ácido nucleico diana que será detectado puede ser ADN o ARN y previamente a la hibridación debe ser marcado con una sustancia fluorescente o radiactiva. Laprincipal ventaja con respecto a las técnicas de biología molecular como la reacción en cadena de la polimerasa es que pueden detectarse en un único procesamiento miles de genes. Sus aplicaciones clínicas están en fase de desarrollo. Sin embargo, cabe especular con algunas posibles aplicaciones futuras. Por ejemplo, Cáncer, Alergia, Inmunodeficiencias primarias, Enfermedades autoinmunes y Enfermedadesinfecciosas. La posibilidad de poder medir simultáneamente la expresión de todos los genes de un genoma, o al menos de una parte considerable de este, abre un abanico de nuevas posibilidades muchas de las cuales aún están por explorar.
Utilidad de un microarreglo de ADN Un microarreglo de ADN sirve para determinar la expresión genética completa de un tejido en un momento determinado. Esta“foto genética transversal” de un tejido concreto se denomina “transcriptoma”. El transcriptoma, al contrario que el genoma (conjunto de todos los genes existentes en una célula), cambia continuamente en respuesta a cambios en las condiciones microambientales celulares o tisulares (temperatura, pH, PO2, citocinas, hormonas, etc.). Por tanto, la interpretación del transcriptoma objeto de estudio requierenecesariamente de su comparación con el de un tejido control. El microarreglo de ADN permite esta comparación, que se conoce con el nombre de differential display.3 Metodología del microarreglo de ADN El procedimiento para comparar el transcriptoma del tejido o cultivo celular objeto de estudio con el transcriptoma control es relativamente simple (Fig. 1). En primer lugar, se debe aislar el ARNmde ambos tejidos y, a partir de cada uno de ellos, obtener sus correspondientes ADNc. Estas moléculas de ADNc deben marcarse con un compuesto fluorescente, que será diferente en los tejidos objeto de estudio y el control. En general, el ADNc del tejido objeto de estudio se marca con el compuesto fluorescente Cy3 (que emite fluorescencia a una longitud de onda de 588 nm, lo que en el espectrocorrespondería a un
ABSTRACT. The aim of the current work has been to do an updated review of the
last years in the development carried out in the technology of the DNA arrays and their application in medical research. The DNA arrays emerge because the necessary of analyzes the quantities information from the projects of the genomics sequences. The DNA arrays or microchips are sets of DNA probesbound to a solid support in a prefixed and regular disposition. The target nucleic acid that can be detected is either DNA or RNA, which is previously labeled with a fluorochrome or a radioactive compound. The main advantage with regards to other molecular biological tools, such as polymerase chain reaction, is that thousands of genes can be detected in a single procedure. The applications of...
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