Microarreglos

micro (pequeño), array (distribución ordenada)
GENÉTICA MOLECULAR SXSV

MICROARREGLOS

MICROARREGLO
Soporte sólido en donde se encuentra un conjunto ordenado de genes inmovilizados sobre unapequeña superficie
10,000 muestras/cm2 Integrado por: prueba y soporte

FUNDAMENTO
Hibridación Detección por fluorescencia
↑ ≠´s ÷ secuencias a evaluar → ↑ hibridación inespecífica Hibridacióninespecífica depende de: secuencia y longitud de la cadena

CLASIFICACIÓN (Medina, E. 2009)
Biomicroarreglos (biochips) → material biológico Microarreglos químicos → moléculas de origen sintéticoCLASIFICACIÓN (Lastra, G. 2005)
Que detectan cambios en la expresión génica Que detectan pérdida de heterogenicidad Que detectan mutaciones en el ADN

DISEÑO DE MICROARREGLOS

SOPORTE EINMOVILIZACIÓN
Poroso Inmovilización no covalente (gel, membranas de nylon o nitrocelulosa sobre portaobjetos de cristal) Liso o no poroso Inmovilización covalente (cristal, silicio, plástico u oro)SONDAS
DNA:


cDNA (spotted arrays) Oligonucleotidos (in situ)



Tipos de sondas
Genómicas
 

Detectan perdida o ganancia de genes Detectan mutaciones en ADN

Trascriptómica
Mide niveles de ARNm

MARCAJE
Directo → durante la síntesis de cDNA Indirecto → marcadores después de amplificar material genético

ETAPAS EN LA EXPERIMENTACIÓN
Etapa 1:
 

Diseño delbiochip Fabricación Preparación de la muestra Hibridación y lavado Revelado: análisis de imagen Análisis de resultados

Etapa 2:
 



Etapa 3:


HIBRIDACIÓN

Competitiva

Nocompetitiva

Prueba (+): un gen determinado esta en la muestra

APLICACIONES
Caracterización de DNA
 

Detección de mutaciones Dx molecular Perfil genético de enfermedades Farmacogenómica Dxmolecular Genómica (funcionalidad de genes)

Cuantificación de DNA
 

Comparación de DNA




VENTAJAS
Rápidos de realizar Que esta pasando en la célula en determinado momento Permite...