Microbacterias

Ecología microbiana: una nueva ciencia para un nuevo siglo
 
Valeria Souza, Ana E. Escalante, Ana M. Noguez, Laura Espinoza, René Cerritos y Luis E. Eguiarte.
 
1. ¿Qué es la ecología microbiana y qué estudia?
La visión general sobre la ecología es meramente antropocéntrica y está relacionada con los problemas de contaminación y en el mejor de los casos con la interacción que el hombre tienecon su ambiente. Sin embargo, las interacciones de los organismos con su entorno comenzaron desde el origen de la vida y han moldeado a nuestro planeta. Por lo que entender el pasado y futuro evolutivos de la vida en la Tierra requiere de un entendimiento de la naturaleza de la vida y de los modos en los que ésta ha surgido y evolucionado en el ambiente con sus componentes bióticos y abióticos.Para nosotros, los ecólogos bacterianos, la pregunta central es tratar de discernir porqué los organismos están en un sitio dado con ciertas abundancias en un tiempo determinado. Dentro del marco de estudio de la ecología es importante evaluar la diversidad, abundancia y distribución de los organismos a diferentes escalas que van desde el paisaje, el ecosistema, las comunidades y finalmente laspoblaciones de las diversas especies.
Y ¿por qué es importante estudiar la ecología? Estudiar la ecología de cualquier organismo nos permite entender muchas cosas, no sólo relacionadas al organismo en cuestión sino del ecosistema al que pertenece, los datos ecológicos nos dan información sobre la historia de los organismos y de su ecosistema así como sobre las cadenas tróficas y los procesosdemográficos. Todo esto nos ha permitido formular teorías sobre los cambios ecológicos que ha sufrido y sufrirá nuestro planeta. En otras palabras, entender la ecología nos ayuda a comprender cómo interaccionan los organismos con su ambiente y cómo ambos cambian debido a estas interacciones, comprender la ecología significa entender los sutiles cambios en el tiempo que constantemente llevan a laadaptación de los organismos. Así, comprender la ecología es entender, en parte, la evolución.
Entonces, si estudiar la ecología es tan importante ¿por qué hay tan poca información para los microorganismos? La principal razón es que ver, caracterizar y contar bacterias no es tan fácil como estudiar plantas o mamíferos. Sin embargo, gracias al descubrimiento de diferentes estrategias moleculares quepermiten identificar a los microorganismos a partir de su DNA ahora podemos caracterizar y contar bacterias casi tan fácilmente como lo hace un ecólogo de plantas o animales. Adicionalmente, los métodos moleculares han abierto nuevas posibilidades de análisis de la función bacteriana. En el capítulo veremos como se ha avanzado en algunos de los aspectos que consideramos más interesantes de la ecologíamicrobiana en los albores del siglo XXI.
 
2. Diversidad y coexistencia
La biomasa de microorganismos terrestres en la superficie de nuestro planeta ha sido estimada como igual a la de todas las plantas marinas y terrestres y tal vez sea el constituyente principal de la biomasa de la Tierra, 1, 2. A pesar de que la diversidad genómica de los microorganismos en el agua y en el suelo puede serdistinta, el número máximo de individuos que integran el taxón dominante es similar: ˜ 104-105 individuos por gramo o mililitro. Este hallazgo sugiere que debe existir algún mecanismo o mecanismos que controlen la densidad de los taxa y que estos deben funcionar de manera más o menos similar en todos los ambientes, mientras que los mecanismos que controlan la diversidad total de la comunidadbacteriana funcionan de modos distintos en agua y suelo. Existen algunas ideas sobre los mecanismos que controlan la diversidad procarionte y ambas tienen que ver con la ecología:
 
a. Interacciones tróficas
Hutchinson, 3, se preguntaba por qué hay tantas especies de fitoplancton en un medio aparentemente homogéneo, en donde todas las especies presentes parecen competir por el mismo tipo de...