Microbiologia

Formación del acido cítrico
La enzima citrato sintasa fue descrita por Severo Ochoa quien la denominó como enzima condensante, pues lleva a cabo una condensación aldólica entre el metilo del Ac-CoA y el carbonilo del oxaloacetato, en la reacción se hidroliza el tioéster y se forma el CoA-SH (succinil-CoA). Esta enzima también cataliza la formación del monofluorocitrato a partir demonofluoro-Ac-CoA. Esta reacción es letal, pues el fluoroacetato no es tóxico, pero el fluorocitrato es inhibidor de la aconitasa, siguiente enzima del ciclo. La citrato sintasa en inhibida por succinil-CoA, ATP, NADPH, ésteres de CoA y ácidos grasos de cadena larga (18C), no se sabe si esto último tiene significado biológico.
La reacción de la citrato sintasa se divide en tres pasos, los dos primeros sonconcertados: 1.- formación del anión tioenolato; 2.- formación del S-citril-CoA (una molécula quiral) y  3.- formación de citrato y liberación de CoASH.

Formación del Isocitrato
La aconitasa cataliza la interconversión entre estos isómeros. La enzima contiene Fe(II) y necesita un tiol como cisteína o glutatión (Glu-Cys-Gly) para efectuar la reacción. Cataliza la adición reversible de H2O al dobleenlace del ácido cis-aconítico, el H y el OH del agua siempre se acoplan en posición trans entre ellos a través de la formación del intermediario cis-aconitato.
Formación del α-cetoglutarato
Es una descarboxilación oxidativa del isocitrato para formar a-ceto(oxo)glutarato y la generación de la primera molécula de CO2 y NADH del ciclo. La enzima que cataliza la reacción es la isocitratodeshidrogenasa, que existe en dos isoformas, una dependiente de NAD+ que sólo se encuentra en mitocondria y otra dependiente de NADP+ que también está en citoplasma.
La enzima dependiente de NAD+ es el catalizador principal de la vía, necesita ADP como modulador positivo, así como Mg2+. Es un homooctámero de 380,000 que es inhibido por NADH y ATP. La isocitrato deshidrogenasa dependiente de NADP+ no esalostérica.
Formación de succinil-CoA
En animales, es una oxidación irreversible del -ceto(oxo)glutarato, proceso catalizado por el complejo de la -ceto(oxo)glutarato deshidrogenasa que consiste en la descarboxilación oxidativa de un cetoácido (-ceto(oxo)glutarato), liberando el segundo CO2 y NADH del ciclo del ácido cítrico. El proceso en general recuerda la reacción catalizada por el complejomultienzimático de la ; en este caso las enzimas que forman el complejo son: -cetoglutarato deshidrogenasa (E1), dihidrolipoil transsuccinolasa (E2) y dihidrolipoil deshidrogenasa (E3). La reacción es análoga a la oxidación del piruvato a Ac-CoA y se produce por el mismo mecanismo, participan como coenzimas: PPi de tiamina,  ácido lipóico,  CoA, FAD+, y NAD+.
Formación de Succinato
Es unadisociación del succinil-CoA, la CoA no se pierde por simple hidrólisis, sino en una reacción de conservación de la energía con el difosfato de guanosina y fósforo inorgánico.
La enzima es la succinil-CoA sintetasa (también llamada succinato tiocinasa), que sintetiza un enlace de alta energía en el GTP. Se ha encontrado que el mecanismo se lleva por la fosforilación de la enzima en una histidina, elmecanismo de reacción consiste de tres eventos:
1.- Succinil-CoA + Pi + Enzima (E) E-Succinil-P + CoA
2.- E-succinil-P E-P + succinato
3.- E-P + GDP E + GTP.
El GTP cede su –P al ADP para formar ATP reacción catalizada por la nucleósido difosfato cinasa, esta es una fosforilación a nivel de sustrato como la que cataliza la piruvato cinasa en la glucólisis.
Formación del Fumarato
La oxidacióndel succinato es catalizada por la succinato deshidrogenasa, flavoproteína que contiene FAD unido covalentemente.
FAD-ribitol-P-P-ribosa
         I               I
      Flavina    Adenina
Esta enzima está unida a la membrana interna mitocondrial, el FAD actúa como un aceptor de hidrógenos en la reacción.
Esta enzima es una ferrosulfoproteína de 100,000 kDa, que contiene un FAD, 8 átomos de...