Modelos Evolutivos Y Filogenia

Resumen de Modelos de Evolución Molecular y Filogenia.

Los modelos matemáticos han contribuido de una forma muy importante a la reconstrucción filogenética, que no sólo se ha nutrido de estastecnologías, sino también de otras disciplinas con el objetivo de encontrar la filogenia última; para esto hoy en día se utilizan modelos que describen y comparan el ADN e incluso aminoácidos.

Parareconstruir las relaciones filogenéticas no basta con obtener la información genética de cada organismo, también se deben estudiar y comparar los datos obtenidos para encontrar semejanzas que permitanagruparlos o diferencias que nos indiquen evolución; para esto antes que nada se necesita seleccionar las secuencias y alinearlas para determinar homologías sitio por sitio (o en su caso notar lasdiferencias). Después, se debe construir con esos datos un modelo construido empírica o paramétricamente que nos de indicios de como evolucionaron los organismos, el siguiente paso es aplicar un métodoestadístico e interpretar los resultados, para así descubrir las relaciones filogenéticas existentes entre los organismos estudiados. El paso más determinante de esta metodología es sin duda laconstrucción del modelo, pues este nos permitirá confrontar la información obtenida y si está bien estructurado, nos dará información veraz sobre las verdaderas relaciones filogenéticas entre los organismos.Debido a que los cambios en el ADN conocidos como mutaciones pueden darse de forma espontánea, presentarse de diversas formas o incluso ser causados por factores ambientales (mutágenos), resulta muydifícil implementar un modelo que incluya todas las reglas de las mutaciones y que permita estudiar el material genético de todas las especies; por eso existen varios modelos que pueden usarse segúnla conveniencia.

Como el Modelo de Markov, en el que se trabaja bajo el supuesto de que existe independencia evolutiva entre los sitios de la secuencia (Trabaja mucho con probabilidades), los...