Pawloski Biologia

Desenredar la filogenia de los protistas ameboides

Departamento de Zoología y Biología Animal de la Universidad de Ginebra, Ginebra, Suiza

RESUMEN. Los protistas ameboides y amebas forman un conjunto amplio y diverso de eucariotas ,se caracteriza por diversos tipos de pseudópodos. Por conveniencia, la morfología tradicional de la clasificación basada en los agrupó en un macrotaxon llamadoSarcodina.
Filogenias moleculares han contribuido al desmantelamiento de este conjunto, colocando la mayoría de sarcodinids en dos supergrupos nuevos:
Amoebozoa y Rhizaria. En esta revisión se describe la composición taxonómica de los dos supergrupos y presentar su subunidad pequeña rDNA basada en filogenia. Se comentan las ventajas y debilidades de estas filogenias y hacer hincapié en lanecesidad de un taxón rico conjuntos de datos de múltiples genes para resolver las relaciones filogenéticas dentro Amoebozoa y Rhizaria. Se demuestra la importancia de la secuenciación del medio ambiente como una forma de taxón de muestreo aumentando en estos supergrupos. Por último, destacamos el interés de Amoebozoa y Rhizaria para la comprensión de la evolución eucariota y sugiere que la solución desus filogenias será uno de los principales retos para los análisis phylogenomic futuras.
Palabras clave: Amebas, Amoebozoa, eucariota, la evolución, foraminíferos, radiolarios, Rhizaria, SSU, ADNr.
DE SARCODINA A AMOEBOZOA Y RHIZARIA
Los protistas ameboides y amebas son una parte importante de diversidad eucariótica, que asciende a cerca de 15.000 se describe especies (Adl et al. 2007), entrelos que hay varios ecológicamente importantes grupos taxonómicos. Lobosas desnudo y amebas testadas son elementos comunes de la tierra y de las comunidades microbianas de agua dulce, e incluyen las especies de importancia médica crítica (por ejemplo, Entamoeba histolytica). Radiolarians se encuentran entre los grupos más abundantes y diversas de holoplancton marina. Foraminíferos bentónicosOrgánica de paredes y aglutinado dominar la meiofauna de aguas profundas, mientras que planctónicos y bentónicos calcáreos grande son algunos de los principales protistas carbonato cálcico, lo que contribuye a casi el 25% de la producción de carbonato de presentday en los océanos (Langer 2008). Tanto foraminíferos y radiolarios son los principales grupos de microfósiles, ampliamente utilizados en lasreconstrucciones paleoclimáticas y paleostratigraphic.
Por conveniencia, todos estos grupos taxonómicos fueron colocados dentro de la clase o Sarcodina phylum, definida como protistas poseen-ción pseudópodos o flujo locomotora protoplasmática, con flagelos generalmente se limita a las etapas de desarrollo (Levine et al. 1980). Dependiendo del tipo de pseudópodos, el Sarcodina se subdividieron en lasuperclase protistas Rhizopodea comprenden que tienen lopobodia, filopodios y reticulopodia y la Actinopodea superclase, integrado por todos los protistas axopodia-rodamientos (Lee, Hutner y Bovee 1985; Levine et al. 1980). Aunque este sistema fue criticado enérgicamente con base en estudios ultraestructurales Patterson (1994), no hay clasificaciones alternativas se han propuesto un-hasta lallegada de las filogenias moleculares.
Las filogenias primera moleculares basados ​​en la subunidad pequeña (SSU) secuencias de ADNr aportó pruebas concluyentes sobre el origen poli-phyletic de protistas ameboides. La ramificación independiente de Acanthamoeba y Naegleria (Clark y Cruz 1988) confirmó las diferencias ultraestructurales entre Lobosea y Él terolobosea-(Page y Blanton 1985). Sin embargo,la distribución irregular de otros protistas ameboides en los árboles eucariotas fue influenciado fuertemente por la heterogeneidad de la tasa de evolución de los genes ribosomales. Los linajes más espectaculares rápida evolución, como foraminíferos (Pawlowski et al. 1996), polycystines (Amaral Zettler, Sogin, y Caron 1997), pelobionts (Hinkle et al. 1994), entamoebids (Silberman et al. 1999), y...