PHYLOGENETIC DE Escherichia coli
Páginas: 3 (588 palabras)
Publicado: 28 de mayo de 2015
PHYLOGENETIC OF Escherichia
coli
Presentado por:
ANDRÉS DAVID VILLAMIL
Biólogo en formación
UNIVERSIDAD DE LA AMZONIA
FACULTAD DE CIENCIAS BÁSICAS
PROGRAMA DE BIOLOGÍA
FLORENCIA – CAQUETÁ
2015
1 CLASIFICACIÓN TAXONOMICA
Descrita
por Theodoro von Escherinch en 1885
2
CARACTERÍSTICAS
MOFOLÓGICAS
Bacilo Gram
Negativo.
Flagelos Peritrico
0.5 µ de ancho y 3
µ largo.
En agar E.M.B. lascolonias son
verdes metálicos
3
CARACTERISTICAS
NUTRICIONALES Y ANTIGÉNICAS
Fermentación de glucosa y lactosa con
producción de gas.
Anaerobio facultativo.
Polisacáridos
Antígeno capsularH
Antígeno somático O
Antígeno flagelar conformado por proteínas.
De acuerdo a esto se clasifican en 5 clases.
4
CLASIFICACIÓN DE E.
coli
5
PROBLEMAS PARA
DETERMINAR PHYLOGENETICINTERCAMBIO GENÉTICO CONSTANTE
6
A Phylogenomic Approach to
Bacterial Phylogeny: Evidence of a
Core of Genes Sharing a Common
History
El
Vincent Daubin1, Manolo Gouy, and Guy
Perrie`re. (2002)Supertree Basado en 730 Genes
Se
utilizó el método MRP, que codifica sólo
los nodos con un valor de arranque
superior a 50%.
Máxima verosimilitud (ML).
Análisis de PCO (Topología)de los 310genes
Protobacteria valor de arranque alto
Datos similares
7
Máxima verosimilitud
8
Análisis de
9
Genomic divergence of Escherichia coli
strains: evidence for horizontal
transfer and variationin mutation
rates
Santiago F. Elena 1* Thomas S. Whittam2. Cynthia L. Winkworth 3
. Margaret A. Riley 4 Richard E. Lenski 5. 2005.
500 pb en 36 genes al azar
Utilización de GenBank AY625099 yAY625134
Servidor NCBI - fragmentos homólogos de
genes en 7 genomas secuenciados
completamente.
E. coli cepa K-12 (comensal)
E. coli cepa B (Comensal)
E. coli cepa O157: H7(enteropatógena)
10
Genomic divergence of Escherichia coli
strains: evidence for horizontal
transfer and variation in mutation
rates
MÉTODOS
Uniéndose de vecinos
Evolución mínima
Máxima parsimonia
Las...
coli
Presentado por:
ANDRÉS DAVID VILLAMIL
Biólogo en formación
UNIVERSIDAD DE LA AMZONIA
FACULTAD DE CIENCIAS BÁSICAS
PROGRAMA DE BIOLOGÍA
FLORENCIA – CAQUETÁ
2015
1 CLASIFICACIÓN TAXONOMICA
Descrita
por Theodoro von Escherinch en 1885
2
CARACTERÍSTICAS
MOFOLÓGICAS
Bacilo Gram
Negativo.
Flagelos Peritrico
0.5 µ de ancho y 3
µ largo.
En agar E.M.B. lascolonias son
verdes metálicos
3
CARACTERISTICAS
NUTRICIONALES Y ANTIGÉNICAS
Fermentación de glucosa y lactosa con
producción de gas.
Anaerobio facultativo.
Polisacáridos
Antígeno capsularH
Antígeno somático O
Antígeno flagelar conformado por proteínas.
De acuerdo a esto se clasifican en 5 clases.
4
CLASIFICACIÓN DE E.
coli
5
PROBLEMAS PARA
DETERMINAR PHYLOGENETICINTERCAMBIO GENÉTICO CONSTANTE
6
A Phylogenomic Approach to
Bacterial Phylogeny: Evidence of a
Core of Genes Sharing a Common
History
El
Vincent Daubin1, Manolo Gouy, and Guy
Perrie`re. (2002)Supertree Basado en 730 Genes
Se
utilizó el método MRP, que codifica sólo
los nodos con un valor de arranque
superior a 50%.
Máxima verosimilitud (ML).
Análisis de PCO (Topología)de los 310genes
Protobacteria valor de arranque alto
Datos similares
7
Máxima verosimilitud
8
Análisis de
9
Genomic divergence of Escherichia coli
strains: evidence for horizontal
transfer and variationin mutation
rates
Santiago F. Elena 1* Thomas S. Whittam2. Cynthia L. Winkworth 3
. Margaret A. Riley 4 Richard E. Lenski 5. 2005.
500 pb en 36 genes al azar
Utilización de GenBank AY625099 yAY625134
Servidor NCBI - fragmentos homólogos de
genes en 7 genomas secuenciados
completamente.
E. coli cepa K-12 (comensal)
E. coli cepa B (Comensal)
E. coli cepa O157: H7(enteropatógena)
10
Genomic divergence of Escherichia coli
strains: evidence for horizontal
transfer and variation in mutation
rates
MÉTODOS
Uniéndose de vecinos
Evolución mínima
Máxima parsimonia
Las...
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