Plan De Negocio

ÍNDICE
Página
CARATULA
HOJA CON EL JURADO DE TESIS
HOJA CON EL NOMBRE DEL ASESOR
DEDICATORIA
AGRADECIMIENTOS
ÍNDICE
LISTA DE TABLAS
LISTA DE FIGURAS
LISTA DE ANEXOS
LISTA DE ABREVIATURAS
RESUMEN
ABSTRACT
I.

INTRODUCCIÓN

01

II.

PLANTEAMIENTO DE LA INVESTIGACIÓN

03

1. Planteamiento del problema

03

2. Marco teórico

05

2.1. Microsatélites

05

2.1.1.Definición

05

2.1.2. Características

05

2.1.3. Distribución, composición y frecuencia

05

2.1.4. Mutación

06

2.2. Parentesco e identidad

09

2.2.1. Parentesco

09

2.2.2. Probabilidad de exclusión (PE)

11

2.2.3. Contenido de información polimórfica (PIC)

12

2.2.4. Razón de probabilidad o Likelihood ratio (LR)

12

2.2.4.1.Índice de Paternidad (PI)13

2.2.5. Valor de LOD en paternidad

14

2.2.6. Valor de Delta

15

2.2.7. Identidad y Probabilidad de identidad (PID)

16

2.3. Diversidad genética

16

2.4. Polimorfismo genético

17

2.5. Cuantificación de la diversidad genética

17

2.5.1. Diversidad alélica

17

2.5.2. Heterocigosidad

18

2.5.3. Índice de Garza-Williamson (G-W)

19

2.5.4. Equilibriode Hardy-Weinberg

19

2.5.5. Equilibrio y desequilibrio de ligamiento

21

2.5.6. Coeficiente de consanguinidad (F o FIS)

21

2.6. Estructura y diferenciación genética poblacional

22

2.6.1. Estadística F

22

2.6.2. Distancia genética

24

2.6.3. Análisis de estructura

26

2.7. Factores que influencian la diversidad y estructura genética

27

2.7.1. Derivagénica

27

2.7.2. Flujo genético y migración

28

2.7.3. Mutación y selección

29

3. Justificación

33

III. OBJETIVOS

36

1. Objetivo general

36

2. Objetivos específicos

36

IV. MATERIALES Y MÉTODOS

37

1. Selección y validación de un panel de marcadores
microsatélites para uso en identificación y verificación
de parentesco en alpacas (vicugna pacos)

371.1. Localización del estudio

37

1.2. Animales

37

1.3. Colección de muestra

37

1.4. Extracción de ADN genómico

38

1.5. Cuantificación y dilución de ADN genómico

38

1.6. Elección de microsatélites

38

1.7. Amplificación de ADN microsatélite y diseño de
paneles de amplificación múltiple
1.8. Elaboración de patrones alélicas

40
40

1.9. Amplificación de 10loci microsatélite para
determinación de parentesco e identidad

41

1.10.

Análisis de datos de loci microsatélite

41

1.11.

Determinación de parentesco e identidad

41

2. Diversidad y estructura genética en poblaciones
de alpacas (Vicugna pacos) mediante análisis de
ADN microsatélite

42

2.1. Localización del estudio

42

2.2. Animales

42

2.3. Colección demuestra

42

2.4. Extracción de ADN genómico

43

2.5. Cuantificación y dilución de ADN genómico

43

2.6. Amplificación de ADN microsatélite

43

2.7. Análisis de diversidad genética dentro de poblaciones de alpacas 45
2.8. Análisis de diversidad genética entre poblaciones de alpacas

46

2.9. Análisis de estructura genética en poblaciones de alpacas

47

V. RESULTADOS

1.Selección y validación de un panel de marcadores
microsatélites para uso en identificación y verificación

48

de parentesco en alpacas (vicugna pacos)

48

1.1. Extracción y cuantificación de ADN genómico

48

1.2. Amplificación de ADN microsatélite

48

1.3. Diseño de paneles de amplificación múltiple

48

1.4. Amplificación de 10 loci microsatélite para
determinación deparentesco e identidad

53

1.5. Análisis de datos de loci microsatélite

53

1.6. Determinación de parentesco e identidad

56

2. Diversidad y estructura genética en poblaciones
de alpacas (Vicugna pacos) mediante análisis de
ADN microsatélite

62

2.1. Extracción y cuantificación de ADN genómico

62

2.2. Amplificación de ADN microsatélite

62

2.3. Diversidad...