Practico De Bioinformatica

Trabajo Práctico N°2
Bioinformática

Myriam Valenzuela Bustamante
Mayo 2012

Secuencia problema es:

>080721-05_H03_FchAATC3-M13F.ab1 953 0 953 ABINNNNNAAGATATCTATGGGCGATTGGAGCTCCGCGGTGCGGCCGCTCTAA
ACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAGCCC AATGTGGAATTCGCCCTTGAGCG
TTACCCCTTGCTTGGAGTTCAAGTCAACGTTTTCGATTCTGGAATAGCAA
TCGGTGTCTCCCTCTCTCACAAGCTCATCGATGGAAGAACGGCATACTGTTTTCTCAAGTCCTGGGGGGCTGTTTTTCGAGGGTGTCGTGAAGATGTCAT
ACATCCTAGTCTCTCTGAAGCAGCATTGCTTTTCCCACCGAGAGATGACT
TACCTGAAAAGTATGCCGATCAGATGGAAGGGTTATGGTTTGCCGGAAAA
AAAGTTGCTACAAGGAGATTTGTATTTGGTGCGAAAGCCATATCTTCAATTCAAGATGAAGCGAAGAGCGAGTCCGTGCCCAAGCCATCACGAGTTCAGG
CTGTCACTGGTTTTCTCTGGAAACATCTAATCGCTGCTTCTCGGGCACTA
ACATCAGGTACTACTTCAACAAGACTTTCTATAGCGGCCCAGGCAGTGAA
CTTAAGAACACGGATGAACATGGAGACAGTGTTGGATAATGCCACTGGAAACTTGATCTGGTGGGCACAAGGGCGAATTCCACAGTG GATATCAAGCTTA
TCGATACCGTCGACCTCGAGGGGGGGCCCGGTACCCAGCTTTTGTTCCCT
TTAGTGAGGGTTAATTGCGCGCTTGGCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGG
AGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGCTAACTCACATT
AATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCC
AGCTGCATTAATGAATCGGCCAACGCGCGGGGAGAGGCGGGTTGCGTATT
GGG

*Secuencias en amarillocorresponden a secuencias del vector de clonación, contaminación de vector como opción en BLAST.

Como resultado de su análisis y guía para su desarrollo deberá responder las siguientes preguntas:1. ¿Es de DNA o PROTEÍNA su secuencia?

Respuesta: La secuencia corresponde a DNA, ya que el lenguaje es nucleotidico (adenina, guanina, timina y citocina)

2. ¿A qué organismo pertenece,describa la taxonomía completa, y desde que tejido fue aislado?

Respuesta: La secuencia pertenece a una parte del transcrito del gen acohol acyl transferasa de Fragaria chiloensis.

La taxonomía es:Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; core eudicotyledons;
rosids; fabids; Rosales; Rosaceae;...