Presentación

6/30/2010

Marcadores moleculares para la predicción
de la calidad de productos pecuarios
Dr. Manuel Parra Bracamonte
Lab. Biotecnología Animal
CBG-IPN
gparra@ipn.mx

Junio de 2010

CONTEXTO NACIONAL
2

1

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CONTEXTO

México
• ~40 razas bovinas

(CONARGEN, 1999)

• Producción de Leche y Carne, preponderantemente
• Sistemas de producción
• Regionesagroecológicas

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CONTEXTO

México
• Carne Consumo → 2.6 millones Tm
• Déficit 400 mil Tm
• Importación
• Limitantes → Exportación
de becerros
Leche Consumo → 4.4 millones Tm
Producción 11.1 millones Tm
Producción por vaca 1.7 Tm vs. 9.3 Tm EUA
4.0 Tm Argentina
Déficit e importación de subproductos:
Quesos, Mantequilla, Leche descremada
FAS/USDA, 2009

4

2

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CONTEXTOLimitaciones
• Infraestructura y apoyo
• Integración de la cadena productiva (agrícola y
pecuaria).
• Estacionalidad de los sistemas
• Vinculo profesional

Investigador

Transferencia
del
conocimiento

Productor

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¿cómo mejorar? ¿La respuesta está en los genes?

n

Variación

Productos y Subproductos

Kg
mm
días
%

3

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Mejoramiento Genético
PrincipiosBiológicos
Económicos
Matemáticos

Cambio
Progreso
Genético

Selección artificial

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¿ A1 = A2 = A3?

Fenotipo
=

$

Ambiente
+

Genotipo
8

4

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Mejoramiento Genético Animal
El progreso genético depende de
• Heredabilidad (Índice de herencia)
• Intensidad de selección
• Variabilidad genética de las características
Paquete o arreglo génico

CajaNegra

Mejoramiento Genético

Genotipo

Fenotipo
Ambiente

10

5

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Mejoramiento Genético: Componentes
Fenotipo: Desempeño cuantificable, lo que se vé
• Ganancia de peso
• Tasa de crecimiento
• Conversión alimenticia
• Rendimiento en canal
• Reproducción
• Producción de leche
• Suavidad de la carne
• Marmoleo
•% Proteína
•Relación de P-MUFA/SFA
11

MejoramientoGenético: Componentes
Ambiente

12

6

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Mejoramiento Genético: Componentes
Genotipo: Potencial innato
Constitución genética = arquitectura genética

• Afectos aditivos
• Progenitores
• Efectos No aditivos
• Dominancia
• En Cruzamiento (Epistasis)

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Mejoramiento Genético
Habilidad de distinguir el mejor
desempeño bajo condiciones particulares
Conocer lavarianza
Saber qué rasgo seleccionar
Saber cómo medirlo
Medirlo
14

7

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GENÓMICA
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GENÓMICA

Cromosoma

Genoma
Célula

Secuencia

Producto

Proteínas

16

8

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GENÓMICA

Variaciones en la secuencia del ADN
• Variación de
secuencia

• Variación
estructural

Cambios nucleotídicos
- Substituciones, mutaciones puntuales
-Inserciónes/Deleciones (indels)
- Polimorfismos de un solo nucleótido
(SNPs)

2 pb a 1000 pb
- Secuencias de DNA repetido en tandem:
DNAsatélite, minisatélite, microsatélites
- Inserciónes/Deleciones (indels)
- Inversiones

GENÓMICA

Marcadores Moleculares
•
•
•
•

Microsatélites o STRs (Simple Tandem Repeat)
SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms)
RFLPs (Restriction Fragment Length polymorphisms)AFLPs (Amplified Fragment Length Polymorphisms)

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GENÓMICA

Marcadores Moleculares

Tipo II

Tipo III

MM EN LA GANADERÍA
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10

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MM EN LA GANADERÍA

• Mejoramiento genético asistido

MM EN LA GANADERÍA

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MM EN LA GANADERÍA

QTL: Locus de característica cuantitativa
12
10
.

5% Genome-wise

F statistic

8
6

5%Chromosome-wise

4
2
0
0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100 110

cM

MM EN LA GANADERÍA

USDA- Resultados del Escaneo de genomas de diferentes
familias
BM
BTA1

PA

BTA2

BTA3

MSTN
RPYD
FATYD

BTA6

BWT, W365,
HCW, LMA

BTA4

BTA5

WBS14

MARB, RPYD
MARB

BTA8
FAT, MARB
FAT

Blackie

Bonzo

RPYD, FATYD

MARB, RPYD...