Proteínas

T.3.Dinamica de las Proteínas

Las proteínas son moléculas dinámicas cuyas funciones dependen de las interacciones con otras moléculas. Se ven afectadas estas interacciones por cambios, a vecesespectaculares y otras sutiles, de la conformación proteica que pueden desencadenar importantes efectos fisiológicos.
Una molécula unida de manera reversible por una proteína se conoce con el nombre deligando, puede ser cualquier tipo de molecula. Incluidas las proteínas. El ligando se une a un lugar de la proteína llamado sitio de fijación, complementario al ligando en tamaño, forma, carga ycarácter hidrofóbico o hidrofílico. La interacción es especifica: la proteína puede diferenciar entre moles de moléculas diferentes de su entorno y unir selectivamente solo una o unas pocas. Una proteínapuede tener diferentes sitios de fijación para diferentes ligandos. Las interacciones son cruciales para mantener el alto grado de orden de una sistema vivo.
Las proteínas son flexibles, los cambiosen su conformación pueden ser sutiles, reflejando vibraciones moleculares y pequeños movimientos de los residuos de aminoácidos a lo largo de la proteína. Los cambios en la conformación pueden sertambién muy grandes, con segmentos importantes de la estructura de la proteína moviéndose incluso varios nanómetros.
La unión de una proteína con un ligando está asociada con un gran cambioconformacional que hace que el sitio de fijación sea más complementario al ligando, permitiendo una unión más fuerte. La adaptación estructural que se produce entre la proteína y el ligando se llama encajeinducido. En una proteína multisubunidad, un cambio conformacional en una subunidad afecta a menudo a la conformación de las otras subunidades. Las interacciones entre ligandos y proteínas pueden serreguladas habitualmente mediante interacciones especificas con uno o más ligandos adicionales, estos otros ligandos pueden provocar cambios conformacionales que afecten a la unión del primer ligando....