proteinas

QUIMICA ORGÁNICA II 2008
CONFORMACIÓN ESPACIAL DE LAS PROTEÍNAS
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Estructura primaria.
Estructura secundaria: hélice α , conformación β , bucles y giros.
Estructura terciaria.
Dominios estructurales
Estructura cuaternaria.

Las proteínas son polipéptidos de gran tamaño. Cada proteína tiene su propia
estructura tridimensional, que la condiciona para cumplir con una funciónbiológica determinada.
Las proteínas se forman a partir de los 20 L-aminoácidos proteinogenéticos,
aunque no todas las proteínas contienen los 20 aminoácidos ni éstos se
encuentran en la misma proporción.
En función del número de cadenas polipeptídicas que forman las
moléculas de una determinada proteína, se pueden distinguir:
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Proteínas monoméricas, están formadas por una solacadena
peptídica
Proteínas oligoméricas, están formadas por varias cadenas
polipeptídicas llamadas subunidades. Estas subunidades pueden
ser idénticas (proteínas homoméricas) o diferentes (proteínas
heteroméricas). El número de subunidades se indica con el prefijo
griego correspondiente: di- (2); tri- (3); tetra- (4), etc., Ej.
homodimérica (2 subunidades iguales), heterotetramérica (4subunidades que no son iguales).

De acuerdo con su composición, las proteínas se pueden clasificar en:
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Proteínas simples: están formadas únicamente por aminoácidos.
Proteínas conjugadas: en su composición, además de la cadena
de residuos de aminoácidos que constituye la parte proteica
denominada apoproteína, hay un componente no proteico,
denominado grupo prostético (apoproteína + grupoprostético =
holoproteína). El grupo prostético desempeña un papel importante
en la actividad biológica de la proteína. Las proteínas conjugadas
se denominan en función de la naturaleza de su grupo prostético,
Ej.:
glucoproteínas,
metaloproteínas,
hemoproteínas,
flavoproteínas, nucleoproteínas, lipoproteínas etc.

Para describir la organización estructural de las proteínas se hanestablecido
cuatro niveles de estructuración, de menor a mayor complejidad, denominados:
estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria. Cada nivel de
estructuración es el resultado de la organización en el espacio del nivel de
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estructuración inferior, así la estructura secundaria es el resultado de organizar
en el espacio la estructura primaria, la estructura terciaria es el resultadode
organizar en el espacio la estructura secundaria, y la estructura cuaternaria es
el resultado de organizar en el espacio las estructuras terciarias. Además,
pueden existir niveles intermedios de estructuración como son los motivos
estructurales y los dominios.

ESTRUCTURA PRIMARIA
La estructura primaria de una proteína describe su secuencia de
aminoácidos y la localización de losenlaces covalentes, si los hubiese, entre
residuos de aminoácidos (por ejemplo, los puentes disulfuro entre cisteínas) y
con grupos prostéticos.

Los polipéptidos homólogos son los que tienen secuencias semejantes de
aminoácidos y suelen tener funciones iguales o similares. Los aminoácidos que
son iguales se denominan invariables y variables los que cambian entre
proteínas homólogas.
Loscambios en la estructura primaria de algunas proteínas pueden ser
causa de algunas patologías. Por ejemplo, la anemia falciforme
(drepanocitosis) se origina por la sustitución en un solo aminoácido (Glu por
Val) de una de las cadenas de la hemoglobina.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
La estructura secundaria se forma por el ordenamiento espacial relativo
de los residuos de aminoácidos próximos entre sí enla secuencia, dando
origen a una determinada conformación local en esa parte del polipéptido.
NOTA: Los carbonos α son puntos de giro de la cadena polipeptídica. Sin
embargo, aunque teóricamente los angulos φ (ángulo de rotación alrededor de
NCα ) y ψ (ángulo de rotación alrededor de CαC) pueden adoptar cualquier
valor, en realidad ciertas combinaciones angulares son imposibles o...