Proteinas

Nomenclatura de una letra de los aminoácidos.
La estructura primaria de una proteína se corresponde con la secuencia lineal de aminoácidos codificada en su correspondiente unidad de transcripción ysuele representarse por medio de una cadena donde cada letra identifica a un aminoácido o residuo. Por ejemplo, los primeros 30 aminoácidos de la proteína insulina de la mosca Drosophila melanogasterson:
MFSQHNGAAV HGLRLQSLLI AAMLTAAMAM...
donde por ejemplo es metionina, es glutamina o es alanina El sentido de la cadena es desde el extremo aminoterminal hacia el carboxiloterminal.

Tabla1.1: Nomenclatura de los 20 aminoácidos esenciales |
A | ALA | Alanina | | M | MET | Metionina |
C | CYS | Cisteína | | N | ASN | Asparagina |
D | ASP | Aspartato | | P | PRO| Prolina |
E | GLU | Glutamato | | Q | GLN | Glutamina |
F | PHE | Fenilalanina | | R | ARG | Arginina |
G | GLY | Glicina | | S | SER | Serina |
H | HIS | Histidina | |T | THR | Treonina |
I | ILE | Isoleucina | | V | VAL | Valina |
K | LYS | Lisina | | W | TRP | Triptófano |
L | LEU | Leucina | | Y | TYR | Tirosina |
X | - |desconocido | | | | |
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De igual manera, la estructura primaria de los ácidos nucleicos es su secuencia de nucleótidos, que tiene un sentido dado por la dirección de los enlaces fosfodiéster. Deigual modo se suele representar de forma simplificada, asignando una sola letra a cada nucleótido, o mejor dicho, a cada base nitrogenada. Además se suele usar el sentido 5'-3'. Por ejemplo, el principiodel gen de la insulina de la mosca Drosophila melanogaster tiene una secuencia similar a:
5' atgtttagcc agcacaacgg tgcagcagta 3'
donde es adenina, timina, citosina y guanina. En el caso del ADN,que como veremos suele formar una doble hélice antiparalela, se sobreentiende que hay una secuencia complementaria que corre en sentido opuesto. En este caso sería:
5' atgtttagcc agcacaacgg...