proteinas

5. Proteínas: Códigos de tres y una letra de aminoácidos

Lista de los códigos utilizados para las proteínas. Algunos autores en diferentes ocasiones utilizan tres letras para indicar la secuencia de aminoácidos. En otros casos solamente se observa la secuencia especificada con una sola letra.













































Laestructura de las proteínas reúne las propiedades de disposición en el espacio de las moléculas de proteína que provienen de su secuencia de aminoácidos, las características físicas de su entorno y la presencia de compuestos simples o complejos que las estabilicen y/o conduzcan a un plegamiento específico.
Estructura de los aminoácidos[editar]


Estructura del aminoácido glutamina.
Losaminoácidos, monómeros componentes del polímero proteína, son moléculas quirales constituidas por un átomo de carbono central, el Cα, que portan en éste un grupo amino y un grupo carboxilo, lo cual les da su nombre, además de un átomo de hidrógeno y una cadena lateral que les confiere sus características definitorias, y en función de la cual se clasifican.1
Los 20 α-L-aminoácidos proteinogénicos son loslistados en la siguiente tabla:
Nombre
Código
de tres
letras
Código
de una
letra
Abundancia
relativa
(%) E.C.
MW
pK
VdW volumen
(Å3)
Cargado,
Polar,
Hidrofóbico,
Neutro
Alanina
Ala
A
13.0
71
 
67
H
Arginina
Arg
R
5.3
157
12.5
148
C+
Asparagina
Asn
N
9.9
114
 
96
P
Aspartato
Asp
D
9.9
114
3.9
91
C-
Cisteína
Cys
C
1.8
103
 
86
P
Glutamato
Glu
E10.8
128
4.3
109
C-
Glutamina
Gln
Q
10.8
128
 
114
P
Glicina
Gly
G
7.8
57
 
48
N
Histidina
His
H
0.7
137
6.0
118
P, C+
Isoleucina
Ile
I
4.4
113
 
124
H
Leucina
Leu
L
7.8
113
 
124
H
Lisina
Lys
K
7.0
129
10.5
135
C+
Metionina
Met
M
3.8
131
 
124
H
Fenilalanina
Phe
F
3.3
147
 
135
H
Prolina
Pro
P
4.6
97
 
90
H
Serina
SerS
6.0
87
 
73
P
Treonina
Thr
T
4.6
101
 
93
P
Triptófano
Trp
W
1.0
186
 
163
P
Tirosina
Tyr
Y
2.2
163
10.1
141
P
Valina
Val
V
6.0
99
 
105
H

El enlace peptídico es un enlace entre el grupo amino (–NH2) de un aminoácido y el grupo carboxilo (–COOH) de otro aminoácido. Los péptidos y las proteínas están formados por la unión de aminoácidos mediante enlacespeptídicos. El enlace peptídico implica la pérdida de una molécula de agua y la formación de un enlace covalente CO-NH. Es, en realidad, un enlace amida sustituido.
Podemos seguir añadiendo aminoácidos al péptido, pero siempre en el extremo COOH terminal.
Para nombrar el péptido se empieza por el NH2 terminal por acuerdo. Si el primer aminoácido de nuestro péptido fuera alanina y el segundo serinatendríamos el péptido alanil-serina.

Anfotérico
Substancia que tiene en su molécula tanto carga positiva como negativa

anfipático
anfipático
Relativo a una molécula que posee dos extremos con características diferentes, como puede ser un detergente, que tiene un extremo polar (hidrofílico) y un extremo no polar (hidrofóbico), pero cuya longitud es suficiente como para que cada uno de losextremos manifieste sus propias características de solubilidad.

Aminoácidos esenciales
Se llaman aminoácidos esenciales aquellos que no pueden ser sintetizados en el organismo y para obtenerlos es necesario tomar alimentos ricos en proteínas que los contengan. Nuestro organismo, descompone las proteínas para obtener los aminoácidos esenciales y formar así nuevas proteínas.
Histidina
Esteaminoácido se encuentra abundantemente en la hemoglobina y se utiliza en el tratamiento de la artritis reumatoide, alergias, úlceras y anemia. Es esencial para el crecimiento y la reparación de los tejidos. La Histidina, también es importante para el mantenimiento de las vainas de mielina que protegen las células nerviosas, es necesario para la producción tanto de glóbulos rojos y blancos en la...