proteinas

DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA SECUNDARIA DE LA CALMODULINA
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Facultad de Biología. Cuarto semestre. Bioquímica 1;
Universidad de Sucre, Sede Puerta Roja (Sincelejo, 20/05/2014)


RESUMEN
La predicción de la estructura secundaria de una proteína, se puede decir que es la determinación de estructura tridimensional de laproteína, a partir de la disposición aminoacídica, los enlaces formados entre los aminoácidos, y las fuerzas intermoleculares no covalentes presentes en la proteína.

En el siguiente trabajo, se realizará la predicción de la estructura secundaria de una proteína llamada calmodulina.

Para la realización de dicha predicción se hará uso de algunos programas bioinformáticas, los cuales arrojan laestructura tridimensional, además de los componentes químicos y estructurales de cada uno de las subunidades de la proteína en cuestión. Algunos de estos programas son Cn3D, expasy, entre otros.

PALABRAS CLAVES:
ABSTRACT
KEYWORDS:


INTRODUCCIÓN
Las proteínas son macromoléculas poliméricas consti­tuidas por cadenas lineales de 20 diferentes aminoáci­dos (aa), a estas cadenas se les denominaestructuras primarias, estas cadenas de aa generan tres grandes grupos estructurales al interior de las proteínas: las α hé­lices, las láminas o estructuras β y las conformaciones coil (C).
A estas con­formaciones se les denomina estructuras secundarias.
La determinación de la estructura secundaria de una proteína se realiza principalmente y de manera más general siempre desde el punto de partidaque indica la estructura primaria de la misma, entendiéndose por ello la cadena lineal de las secuencias de aminoácidos que generan la personalidad de la molécula, la predicción de la estructura secundaria de una proteína es de vital importancia pues determina la disposición espacial de la molécula, como se pliega , cuales son los ángulos que desarrollan sus átomos y por tanto la formación dehélices u otras estructuras regulares que a su vez determinan el comportamiento de la molécula en los diferentes ambientes biológicos donde pueda o no pueda desempeñarse, siempre teniendo como parte basal, su secuencia primaria de aminoácidos.
El ión calcio es reconocido como un mensajero esencial, es responsable de la regulación de un amplio rango de procesos celulares. En células diferenciadasregula funciones tan específicas y diversas como contracción muscular, exocitosis, metabolismo de segundos mensajeros, control del ciclo celular, metabolismo energético y regulación de la transcripción, entre otras. Sin embargo, el calcio en altas concentraciones es citotóxico para la célula. Por ello los niveles de calcio intracelular son mantenidos entre 20-100nM, muy por debajo de lasconcentraciones que se encuentran normalmente en los fluidos extracelulares (rango mM). La función de mensajero la debe ejecutar junto con un sistema muy estricto que mantiene la homeostasis de calcio interno. el sistema esta compuesto por bombas de calcio que sacan el ión al exterior de la célula o lo transportan a depósitos intracelulares (retículo endoplásmico), por intercambiadores de iones (Na+/Ca2+),por canales que permiten su ingreso y por proteínas de unión a calcio que lo secuestran.

PROTEÍNAS DE UNIÓN AL CALCIO
En respuesta a un estímulo la concentración de calcio intracelular puede aumentar rápidamente, por la entrada de calcio extracelular o por la liberación del ión a partir de los depósitos internos. Este cambio de concentración es una señal, que es detectada en la célula porlas proteínas que se unen a calcio. Estas proteínas pueden ser subdivididas en dos grupos: Las proteínas sensores que tienen papel en transducción de las señales de calcio, ellas cambian de conformación después de unir el ión y luego interactúan con sus proteínas blanco. Las proteínas buffer que actúan como transportadores o buffers de calcio. Su principal función es mantener la homeostasis, por...