proteinas
Funciones
• Estructura general de los aminoácidos
PROPIEDADES DE LOS AMINOÁCIDOS
Por ello, estos compuestos orgánicos se conocen como -aminoácidos porque
con excepción de la prolina (que contiene un grupo amino secundario), los 19
restantes tienen un grupo amino primario, un substituyente ácido carboxílico
además de un hidrógeno y un substituyente diferente en elmismo átomo de
carbono.
ESTEROISOMERÍA
Los carbonos son centros ópticamente activos o quirales, tienen cuatro
substituyentes diferentes (este fenómeno no sucede en la glicina cuyo grupo R es un
átomo de Hidrógeno), que pueden ocupar dos diferentes arreglos espaciales que son
imágenes especulares (de espejo) no superponibles
A pesar de que en la naturaleza se encuentran tantoisómeros L como D, los
aminoácidos que forman parte de las proteínas son normalmente L.
Los aminoácidos D se encuentran solamente en pequeños péptidos de la pared
celular bacteriana y en algunos antibióticos.
La estereoespecificidad de algunas reacciones catalizadas por enzimas se debe a
la asimetría de sus sitios activos, la cual está dada por las características quirales
de los aminoácidos quelas componen
Nomenclatura de los aminoácidos
Alanina
Arginina
Asparagina
Aspártico
Cisteina
Fenilalanina
Glicina
Glutámico
Glutamina
Histidina
Isoleucina
Leucina
Lisina
Metionina
Prolina
Tirosina
Treonina
Triptófano
Serina
Valina
Ala
Arg
Asn
Asp
Cys
Phe
Gly
Glu
Gln
His
Ile
Leu
Lys
Met
Pro
Tyr
Thr
Trp
Ser
Val
A
R
N
D
C
F
G
E
Q
H
I
L
K
MP
Y
T
W
S
V
Clasificación
Hidrofobicos: grupo R no polar
Hidrofílicos: Grupo R polar
neutro
cargado
Clasificación y propiedades específicas de los aminoácidos
Aminoácidos esenciales y no esenciales
Una clasificación usual de los aminoácidos se refiere a si son esenciales o
no para los organismos, en particular para los heterótrofos.
Esencial se refiere a que lamaquinaria enzimática que posee el organismo
estudiado no es capaz de sintetizar a la molécula, de ahí que deba ser ingerida en
la dieta.
His* Arg*
Val
Leu
Lys
Met
Thr
Phe
Trp
Los autótrofos, son los organismos fotosintéticos, que al no recibir aporte de energía
externa más que en forma de luz, deben sintetizar todas sus biomoléculas y, por tanto,
poseen toda la maquinariametabólica para sintetizar a todos los aminoácidos.
Clasificación en base a su grupo R
Clasificación en base a su grupo R
6
6
3
3
2
Niveles estructurales en las proteínas
Estructura primaria: Secuencia de aminoácidos
Estructura secundaria: Plegamiento básico de la cadena
debido a enlaces de hidrógeno entre grupos -CO- y -NHdel grupo peptídico: hélices, láminas ygiros
Estructura terciaria: Estructura tridimensional de la proteína
Estructura cuaternaria: Asociación de distintas subunidades,
Cada una corresponde a un polipéptido.
Estructura primaria
DNA
RNA
Proteína
5’-AAGGGTACCCAACATTTAGTT-3’
3’-TTCCCATGGGTTGTAAATCAA-5’
5’-AAGGGUACCCAACAUUUAGUU-3’
N Lys.Gly.Ser.Gln.His.Leu.Val C
ENLACE PEPTIDICO
Características generales
•Elenlace peptídico es un enlace entre el grupo amino (–
NH2) de un aminoácido y el grupo carboxilo (–COOH) de otro
aminoácido.
•El enlace peptídico implica la pérdida de una molecula de
agua y la formación de un enlace covalente CO-NH.
•Se agregan aminoácidos al extremo COOH terminal
•Para nombrar el péptido se inicia por el NH2 terminal. Por
ejemplo, si el primer aminoácido de elpéptido inicia con
alanina y el segundo con serina se tendría al péptido alanilserina.
ENLACE PEPTIDICO
Estructura Secundaria de Proteinas
El oxígeno carbonilo tiene una carga parcial negativa y el
nitrógeno amida tiene una carga parcial positiva, dando lugar a
un pequeño dipolo eléctrico. Prácticamente todos los enlaces
peptídicos en las proteínas ocurren en la posición trans....
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