Proteoma

Proteoma
Proteoma- 1994, es el grupo completo de proteinas que son expresadas por el genoma completo durante el tiempo de vida de una celula.
Proteomica- es el estudio del proteoma usandotecnologias de separacion e identificacion de proteinas a gran escala.
Separacion- geles 2D, cromatografía líquida
Identificación- MALDI MS, TANDEM MS/MS, FT-MS
Proteina, cadena de aminoacios, unidos porenlaces peptidicos
La funcionalidad de las proteinas es gracias a su plegamiento en distintas estructuras 3D.
Molecula modelo: hemoglobina (cuaternaria)
Interacciones que estabilizan las estructuras-no covalentes: fuerzas de van der waals, puente de hidrogeno, hidrofobicas .
Puentes de hidrogeno:Atomo electronegativo donador (N u O), hidrogeno unido al donador, atomo electronegativo donador …….Puente disulfuro: union de dos gpos tioles que se encuentran en la cadena lateral de las cisteinas, unen partes distantes de una cadena polipeptidica o aminoacidos distantes.
Quiralidad: cuando enun aa solo cambia la cadena lateral (D, L)
Angulos dihedrale: la rotacion en los enlaces determina el plegamiento de las proteinas, estructura 3d. Angulos de torsion (angulos dihedrales T): miden laorientacion de 4 atomos unidos en una molecula.
Impedimiento esterico: interferencia a la rotacion causada por un arreglo espacial de atomos dentro de una molecula .
Ramachanndran: uso metodoscomputacionales de pequeños polpeptidospara varias sistematicamente los angulos y asi encontrar conformaciones estables.
Proteinas homologas: enterooxina y la toxina del colera. No homologas- cytocromo ybarstar. Anemia falciforme es una mutacion la cual no es aceptada ya que modifica los eritrocitos y los convierte en forma de hoz , modificando un aminoacido altamente polar por uno no polar.
Perfilde expresion proteica, perfil proteico o proteina distintiva: se usa para encontrar y diagnosticar una enfermedad o afeccion y observar que tan bien responde el cuerpo al tratamiento.
Los niveles...