Qüestions Setmana 5

Qüestions. Setmana 5.
Article 1
Si mires l'apartat de Mètodes, a la pàgina 60 de l'article, veuràs que els autors expliquen de forma molt resumida que per seqüenciar el genoma van utilitzar elque anomenen "whole genome shotgun strategy". Explica en que consisteix.
Aquesta estratègia consisteix en seqüenciar el genoma de forma ràpida. Aquest sistema consisteix en trencar el genoma enpetits fragments de DNA que seran seqüenciats per mirar l’ordre de les bases i posteriorment aquests fragments s’ajuntaran mitjançant programes d’ordinador que permetran veure quins fragments es trobensuperposats.
A quin grup filogenètic pertany Rhodopseudomonas palustris?
Pertany a les alfa proteobacteries, sent un bacteri porpra.
En quin tipus d'habitat s'acostuma a trobar aquestmicroorganisme?
Es troba àmpliament distribuït a la natura des de llargs, fins a sediments marins o bassals d’aigua.
A què es refereixen els autors quan afirmen que R. palustris té un metabolismeextraordinàriament versàtil?
Es refereixen a que pot créixer en qualsevol dels quatre tipus de metabolisme que hi ha.
Quants cromosomes formen el genoma de R. palustris i quina mida tenen?
El genoma estacompost per un sol cromosoma circular que te una mida de 5,46 Mb.
La mida total del genoma és gran o petita si la compares amb la d'altres organismes seqüenciats?
Comparat amb altres organismesseqüenciats, la mida total del genoma si que és gran.
Quants gens hi ha codificats en aquest genoma?
Es prediu que hi ha 0,881 gens per kb,.4.836 gens.
S'ha identificat la funció que porten a terme?La funció que duen a terme és de codificar proteïnes que s’inclouen en les diferents vies metabòliques, proteïnes que codifiquen per bases, etc.
Quin percentatge del total d'aquests gens estàdedicat a cada una de les funcions cel·lulars majoritàries?
Energia del metabolisme, biosíntesis, metabolisme de carboni i nitrogen: 31%
Transport: 14,5%
Senyals de transducció: 4,7%
Transcripció:...