QTL genetica 1

Mapeo de QTL para tolerancia a etanol en Drosophila melanogaster.
Resumen:
Con el objetivo de mostrar las técnicas de mapeo genético y QTL. Se investigó las bases moleculares de la tolerancia al EtOH en lineas RIL. Se dispone del genoma secuenciado y anotado de D. melanogaster (Adams et al.2000) y de los mapas genéticos de las RIL correspondientes a los microsatelites, posteriormente seprocede con el análisis de QTL (Quantitative trait locuspara) la tolerancia al EtOH. Se utilizó una población de 26 individuos, proveniente de una F1 retrocruzada con los machos parentales, se obtuvo la F2 y se iniciaron líneas independientes, cada una de ellas fue continuada por 14 generaciones con cruzamientos hermanos para tener los homocigotas. Se definió un Lod score de 11.5 en QTL- Cartographer,y luego se realizo el análisis de QTL reveló la presencia de tres QTL para la tolerancia al EtOH.
Objetivos.
Se quiere medir un carácter cuantitativo para luego aplicar técnicas de mapeo de QTL para localizar genes candidatos que se creen contribuyen al carácter en estudio, que en este caso es la tolerancia a etanol
Introducción
Al locus de un gen que afecta un carácter cuantitativo se ledenomina en inglés “quantitative trait locus” (locus para un carácter cuantitativo) y se le conoce por la sigla QTL. Los QTL no pueden identificarse en genealogías porque sus efectos individuales están enmascarados por los efectos de los otros genes que influencian la característica y por los efectos ambientales. Sin embargo los QTL pueden localizarse si están genéticamente ligados a marcadorespolimórficos de ADN, ya que el genotipo que afecta al carácter cuantitativo podrá relacionarse con el genotipo del marcador genético ligado. La ubicación de los QTL en el genoma es importante para su manipulación en programas de mejoramiento, y para poder clonarlos y estudiarlos de manera de identificar sus funciones.
Los marcadores polimórficos de ADN son abundantes y están distribuidos por todo elgenoma. Además poseen varios alelos co-dominantes de manera que resultan ideales para estudios de ligamiento de los caracteres cuantitativos. En los estudios de QTL se utiliza el mayor número posible de marcadores, ampliamente distribuidos, junto con el carácter complejo en cuestión, en generaciones sucesivas de una población genéticamente heterogénea. Luego se llevan a cabo estudios estadísticoscon el fin de identificar qué marcadores de ADN están asociados con el carácter complejo, de manera que sus genotipos están siempre asociados por efectos fenotípicos que interesan. Estos marcadores de ADN identifican regiones del genoma que contienen uno o más QTL con efectos importantes sobre el carácter cuantitativo. Entonces los marcadores pueden utilizarse para estudiar la segregación deregiones importantes en programas de mejoramiento, y también como punto de partida para clonar los genes con efectos importantes sobre el carácter en cuestión.
Existen factores ambientales que afectan a los caracteres cuantitativos. El efecto primario del ambiente es el de cambiar el valor para un genotipo en particular. La consecuencia de estos efectos ambientales es que la distribución de lafrecuencia fenotípica se asimila aún más a una distribución normal
Entonces el genotipo es la suma de los efectos genéticos y ambientales. Expresado en forma matemática:
Fenotipo = Factores genéticos + Factores ambientales (1)
Al considerar la Genética Cuantitativa uno de los objetivos importantes es el poder determinar la importancia relativa del genotipo y del ambiente.
Para el corriente trabajopractico tuvimos en cuenta que los cambios celulares inducidos por el EtOH se solapan frecuentemente con los inducidos por el estrés de calor (Scholz et al. 2005), Dado que son chaperones moleculares pueden estar directamente relacionados con la adaptación al estrés ambiental. Pero no todos los genes candidatos para resistencia al estrés por EtOH codifican para los inducidos por estrés al calor....