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La fundación española de Moquegua, si bien existen datos mas o menos concretos sobre la fundación incaica de Moquegua que tuvo como cacique los últimos años del Incanato a Tito Atahuiche, fundación Inca que antecedió en muchos años a la de Arequepay, llevada a cabo con el mismo Mayta Cápac en la postrimerías de su gobierno , no ocurre lo mismo en lo que respecta al año en que Moquegua fueraincorporada a la vida española, al igual que el pueblo de San Sebastián de Escapagua (Alto de la Villa), incorporación que debio tener cierta simultaneidad, considerándose la pequeña distancia de 2 Kilómetros que separa de otro pueblo.
Dedicado por la Iglesia el 25 de Noviembre a Santa Catalina y Alejandro, patrona de Moquegua, se supone con bastante fundamento que en ese día se fundó la ciudad. Solose sabe que fueron trece sus fundadores, descubridores o conquistadores.
Gustavo Valcárcel, en su primera edición del trabajo de Antonio Montenegro anota 34 familias españolas asentadas en el pueblo de Santa Catalina de Moquegua, 1611. Siendo los primeros pobladores en la Villa: Juan Guerrero de Vargas, Diego Fernández Maldonado, Ramón Hurtado de Mendoza, Alonso de Vizcarra, Luis de Alcazar yPadilla, Juan de Mazuelo, Andrés de Espinoza, Juan de Adrada, Francisco de Saavedra, Luis Vélez de Cordova, Cristóbal Pérez Cugate, Martín Vélez de Córdova, Bartolomé Julián Salazar, Fernando de Tovar, Juanes de Zaconeta, Diego Fernández Talavera, Diego Velasquez, Juan Bueno de Salazar, Francisco Rodriguez Ballón, Pedro de Villalobos, Gabriel Ladrón de Guevara, Gerómino de Barrios, Juan Escobar,Diego Rodríguez de Santenda, Julián Martínez, Baltazar Berru, Isidro de Cácares, Pedro de Quiroz, Juan de Apráez, Juan del Rio, Pedro Díaz, Francisco Rodríguez, Diego Bravo, y Gerónimo Duarte. Estos son los vecinos del pueblo de Santa Catalina de Moquegua en Agosto 14 de 1611.
Con las desastrosas consecuencias que siempre trajo consigo los movimientos sísmicos, en distintas épocas, pocas noticias setienen de los sismos ocurridos en la época incaica. El cronista y Religioso Mercedario Martín de Murrua, citado por Luis E. Valcárcel en su historia del Perú antiguo, relata que en tiempo del Inca Yupanqui, padre de Túpac Inca hubo un grandísimo terremoto, sin poder precisar el año, esto debió ocurrir entre los años 1439 y 1475.
El 15 de Febrero de 1600, erupcionó el volcán Omate, Quinistaquillaso Huayna Putina, en esos tiempos lo llamaban Chiquiputina o Volcán de Mal Agüero. El 25 de Noviembre de 1604, arruino la Iglesia de San Sebastián, que reedificó el regidor de San Sebastián de Escapagua, Don Juan de Olea y Medina, en lo que en la actualidad es el "Alto de Villa". El 27 de Noviembre de 1630, nuevamente se destruye la Iglesia Matriz, se reconstruyó con un aporte de 35,000 pesos,aporte de Mencía o Merencio de Castro, y Don Ambrosio Javier Galdómez y la Corte Real.
El 13 de Noviembre de 1655, por tercera vez cae la Iglesia Matriz reedificada por Don Pedro de Alcazar y Padilla. El 21 de Octubre de 1687, Mendiburu, menciona este terremoto acaecido en Arequipa y Moquegua. El 22 de Agosto de 1713, el cabildo de Moquegua, juró hacer cada año el 15 de Agosto una fiesta a nuestraSeñora de Loreto, sin que llegara a cumplirse la promesa hecha. El 3 de Mayo de 1784, día jueves a las siete y treinta de la mañana, se produjo el terremoto cuya duración fue de 4 a 5 minutos, a consecuencia de este, por cuarta vez se derrumbó la Iglesia Matriz. El Vicario Moqueguano, Lorenzo Vizcarra Hurtado de Mendoza, emprendió en 1792 con su aporte de 29,000 pesos la construcción de la NuevaIglesia Matriz.
En una de las columnas del corredor del antiguo convento de los jesuitas, dice: "El gran terremoto del 13 de Noviembre de 1833". El 13 de Agosto de 1868, por los efectos del Sismo, la Iglesia Matriz quedó abandonada, fue construida por el Arquitecto Miguel Gerónimo. El 11 de Mayo de 1948 a las 03:57 de la madrugada se produjo un terremoto de grado siete de la escala de mercali....