Repaso de biología molecular

Apuntes repaso Biología Molecular
Unidad 6:
Código genético

Redundancia, codones sinónimos, degeneración del código genético.
64 tripletes para 20 aminoácidos, 1 señal de inicio AUG, 3 señales de paro (no codifica para ningún aa) UAG, UGA, UAA.
mRNA policistrónico: presenta varios codones de inicio (AUG), da lugar a varias proteínas, lleva información de varios genes, habitual enprocariotas. “OPERÓN”
mRNA: monocistrónico: presenta un solo codón de inicio (AUG), da lugar a una proteína, lleva información de un solo gen, habitual en eucariotas.
Universalidad
Traducción y mecanismos postraduccionales
Traducción: síntesis de proteínas mediante la unión de aa según el orden establecido por la secuencia de nucleótidos del mRNA y el código genético.
-Gen: región codificante del DNAgenómico responsable de un producto génico (proteína, RNA, etc.)
-Cistrón: región codificante del genoma (DNA) así como del mRNA que codifica un producto génico UNICO.
-Fase previa o de activación: Consiste en la unión de cada tRNA (hay 31 tipos) al aa correcto, formando el complejo aminoacil-tRNA
-Ocurre en el citosol, mediante la enzima al aminoacil-tRNA sintetasa (aaRSs)
-La reacciónocurre en dos pasos, primero la unión del aa a la enzima y luego la unión al tRNA para formar el complejo aminoacil-tRNA
-La unión entre el aa y el tRNA ocurre entre el grupo carboxilo del primero y el OH del tRNA, dejando libre al grupo amino para la elongación de la cadena polipeptídica.
-La unión de los aa en el centro activo de la sintetasa ocurre por interacciones tipo puentes de hidrógeno ,electrostáticas e hidrofóbicas.
Existen 2 tipos de sintetasa, tipo I y tipo II.
Sintetasa
Grupo OH del tRNA
aa que reconoce

Tipo I

2'
10, los más grandes y polares: Arg, Cys, Gln, Glu, Ile,Leu, Met, Trp, Tyr y Val

Tipo II

3'
10: los más pequeños e hidrófobos: Ala, Asn, Asp, Gly, His, Lys, Phe, Pro, Ser y Thr

Teoría del balanceo: implica la relación entre el codón del mRNA y elanticodón del tRNA en el ribosoma. Las uniones entre los dos primeros nucleótidos es por apareamiento de bases tipo Watson y Crick (unión estable) mientras que el último nucleótido queda unido mediante puentes de hidrógeno (≠ a los de Watson y Crick) más débiles, lo que permite cierta flexibilidad y posibilidades de adaptación para el reconocimiento de los 64 codones por parte de las 31aminoacil-Trna.
I. Iniciación: comprende la disociación del ribosoma, la unión del tRNA y del mRNA hasta el reensamblaje del ribosoma.
I.1 Disociación del ribosoma (separación en las 2 subunidades que lo componen: 60S y 40S) para que quede libre el sitio activo del mismo. Esto ocurre debido a la interacción entre factores de iniciación (IF-3, IF4-C, IF-6)
I.2 Unión del tRNA al codón de inicio AUG en elmRNA en el sitio P (Peptidilo) en la subunidad menor del ribosoma, formando el complejo de preiniciación. Esto puede ocurrir deforma dependiente de la caperuza o de forma dependiente a la misma.
a) Dependiente de la caperuza: la caperuza es reconocida por el eIF-4E, denominado CBP (Cap binding protein). Tras esta unión, el ribosoma se desplaza corriente abajo hasta encontrar el codón de inicioAUG y así comenzar la síntesis proteica. Además intervienen los factores eIF-4Ay eIF-4B
b) Independiente de la caperuza: no necesita que el ribosoma empiece a recorrer el ARNm desde el extremo 5' hasta el codón de comienzo. Los ITAF (IRES trans-acting factor) pueden colocar al ribosoma en el sitio de inicio, evitando la necesidad de recorrer el ARNm desde el extremo 5' de la región sin traducirdel ARNm.

I.3 Unión de la subunidad mayor del ribosoma para formar el complejo de iniciación. Esto ocurre posteriormente a la separación de los factores proteicos de la subunidad menor del ribosoma debido a la poca afinidad entre Met-tRNA y el complejo eIF-2:GDP.
II. Elongación: Incluye desde la adición del segundo aa hasta el último. Es un proceso cíclico que consta de 3 pasos que se...