rotavirus

Diversidad, evolución y efecto de las vacunas en Rotavirus
Características de rotavirus
El rotavirus pertenece a la familia de virus reoviridae, y se caracteriza por tener una simetría icosahedrica. (Romero et al. 2007) Dicho virus mide alrededor de 100nm y está compuesto por 11 segmentos de RNA de doble cadena. (Patton, 2012) Cada uno de dichos segmentos codifica una proteína estructural ono estructural, el segmento numero 11 puede codificar dos proteínas en el grupo de rotavirus A, produciendo una proteína no estructural extra NSP6. (Matthijnssens et al. 2011)
Seis proteínas estructurales son codificadas, desde VP1 a VP4, VP6 y VP7. VP1 consiste en una RNA polimerasa dependiente de RNA que está localizada en el core del virión junto VP3 que es una enzima Cap. VP2 es la proteínaque forma la capa más interna de la cápside. Todo este core está rodeado por una capa de VP6 seguida por una capa de VP7. Protegiendo la última capa de Vp7 se encuentra la Proteína VP4, que cuando es clivada da lugar a otros polipéptidos VP8* y VP5*. (Patton, 2012) (Fig. 1)
Cinco o seis proteínas no estructurales son codificadas, desde NSP1 a NSP6, estas proteínas no estructurales tienen variasfunciones incluyendo la replicación del genoma, ensamblaje de partículas, regulación de la respuesta inmune del hospedero y estimulación de la expresión de los genes virales. (Matthijnssens et al. 2011)


Figura 1: Estructura de la cápside de rotavirus. A: estructura externa de la cápside intacta. B: corte longitudinal exponiendo cada una de las capas. C: estructura de VP4, mostrando lospolipéptidos VP8* y VP5*.
Clasificación de rotavirus
Dependiendo a las propiedades antigénicas de la proteína VP6, estos viruses se dividen en diferentes especies, siendo nombrados desde A a E y dos especies tentativas F y H. (Matthijnssens et al. 2011) La mayor parte de cepas que infectan a humanos y animales pertenecen a los especies o grupos A, B y C, siendo las cepas del grupo B características degastroenteritis en personas adultas, mientras que las especies o grupos D, E, y G solo infectan aves. (Patton, 2012)
Por otra parte dichos virus se clasifican en diferentes serotipo dependiendo de las proteínas VP4 y VP7, ya que estas provocan respuestas neutralizantes por diferentes anticuerpos. (Iturriza-Gómara et al, 2004) VP4 es una proteína sensible a las proteasas y VP7 a las glicoproteinas.(Walter, 2007) mediante dicha clasificación se describieron 27 serotipos G, del G1 al G27 y 35 serotipos P, del P1 a P35 y no se sabe en qué medida cada genotipo es antigénicamente diferente de otro. (Matthijnssens et al. 2011)
Por otra parte se encontró que existen diferentes clasificaciones, que a diferencia de la mencionada anteriormente, toman en cuenta todas las proteínas codificadas por elgenoma rotaviral y no solo los diferentes serotipos de VP4 y VP7.
En dicha clasificación existen dos genogrupos, el genogroupo WA o 1 y el genogrupo DS-1 o 2. (McDonald et al. 2009) En esta se encontró que las diferentes variantes o alelos de cada uno de los genes presentes en el genoma rotaviral, que son 4 o 5 alelos por gen, (McDonald et al. 2009) pueden pertenecer ya sea al genotipo uno o algenotipo 2 y si la mayoría de estos pertenecen a uno de los genotipos se dice que forman parte del genogrupo 1 o 2. (Patton, 2012)
Diferentes cepas presentes en epidemias globales
Una de las características de estos virus es que se presentan de manera estacional. En climas templados las infecciones se presentan en meses fríos y secos, mientras que en climas tropicales estos pueden estarpresenten durante todo el año.
Por otra parte las diferentes combinaciones de serotipos varían mucho durante cada estación epidemiológica.
De manera global las cepas más comunes en humanos pertenecen a G1, G2, G3, G4 y G9 combinadas con P[4], P[6] o P[8], siendo G1P[8], G2P[4], G3P[8] y G4P[8] las combinaciones más importantes (Santos et al. 2005)
Las cepas G1P[8],G3P[8], G4P[8], y G9P[8]...