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Actualmente se focalice la isomerización de fracciones de pentane y hexano como componentes de naftas, a fin de evitar el uso de aditivos en base a Plomo (tóxicos). Los componentes de C5/C6 son partede la nafta liviana como corte de destilación.
Para lograr un rendimiento aceptable de isómeros a bajas temperaturas, se usó como catalizador en las primeras unidades, el cloruro de aluminio, peroestos catalizadores tenían la desventaja de ser muy corrosivos, por lo cual, se cambiaron a catalizadores sólidos consistentes en un soporte con un carrier ácido y una función hidrogenante,frecuentemente un metal noble. Actualmente se usan estos catalizadores de doble funcionalidad, que operan en fase vapor y en presencia de hidrógeno.

La reacción de reagrupamiento puede afectar a los enlacesentre los átomos del sustrato, generando un isómero de constitución, o consistir en un cambio sólo estructural, generando un estereoisómero. En ambos casos suele hablarse de isomerización. Debenotarse que, cuando las diferencias de energía entre distintas estructuras son muy pequeñas, se trata de confórmeros (por ejemplo, los alcanos, el H2O2, la hidrazina (NH2NH2) y se entiende que, atemperaturas ordinarias, existen todos en equilibrio dinámico en proporciones determinadas por sus estabilidades relativas y la temperatura. En este apartado solo se considerarán las transformaciones entreisómeros.
Isomerización

Este proceso involucra la transformación de una estructura molecular en otra (isómero), en donde los átomos de los componentes son los mismos pero en un arreglo distinto encuanto a su estructura geométrica. Los isómeros difieren en general en sus propiedades químicas y físicas. Los isómeros que interesan en este proceso son los que tienen propiedades más favorables encuanto a su utilización como combustibles el caso de las n-parafinas que se convierten en iso-parafinas, lo cual incrementa el número de octanos de la corriente de hidrocarburos.
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