SecuenciacióndeKéfires

http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0069371
ARTÍCULO DE INVESTIGACIÓN
ANÁLISIS DE SECUENCIACIÓN de la composición bacteriana y fúngica de granos y leches de kéfir de varios orígenes Alan J. Marsh, Orla O'Sullivan, Colin Hill, R. Paul Ross, Paul D. Cotter
Resumen
Introducción
Materiales y métodos
Resultados
Discusión
Apoyo a la información
AgradecimientosContribuciones de autor
Referencias
RESUMEN
El kéfir es una bebida a base de leche fermentada a la que se han atribuido una serie de propiedades que promueven la salud. Los microbios responsables de fermentar la leche produciendo kéfir son una asociación compleja de bacterias y levaduras, ligadas dentro de una matriz de polisacárido, llamado grano de kéfir. La composición de esta poblaciónmicrobiana, presente en la bebida resultante, ha sido tema de diversos estudios anteriores, casi exclusivamente basados en el cultivo, que tienen diferencias marcadas dependiendo de la ubicación geográfica y las condiciones de cultivo. Pero el estudio de identificación basado en el cultivo es limitado, ya que sólo detecta especies que puedan crecer en el medio específico usado y por tanto al margen delcultivo; las técnicas de base molecular ofrecen potencial para un análisis más exhaustivo de tales comunidades. Aquí se describe una investigación detallada de la población microbiana del kéfir, tanto bacteriana como fúngica, usando Secuenciación de Alto Rendimiento para analizar 25 kéfir de leche y granos asociados procedentes de 8 regiones geográficas distintas. Esta es la primera ocasión en queesta tecnología se ha empleado para investigar el componente fúngico de estas poblaciones o para revelar la composición microbiana de un extenso número de granos de kéfir o leche. Como resultado de ello se dieron a conocer varios géneros y especies no identificadas previamente en el kéfir. Nuestro análisis muestra que las poblaciones bacterianas en el kéfir están dominadas por 2 filos, las firmicutesy las proteobacterias. También se fijó que las poblaciones de levaduras del kéfir estaban dominadas por los géneros kazachstania, kluyveromyces y naumovozyma , pero que una población sub-dominante variable también existe.

Cita: Marsh AJ, O'Sullivan O, Colina C, Ross RP, Cotter PD (2013) Análisis de secuenciación basada en la composición bacteriana y fúngica de granos de kéfir y leches demúltiples fuentes. PLoS ONE 8 (7): e69371. doi: 10.1371/journal.pone.0069371
Editor: Colin Dale, de la Universidad de Utah, Estados Unidos de América
Recibido: 24 de marzo 2013; Aceptado: 07 de junio 2013, Publicado: 19 de julio 2013
Copyright: © 2013 Marsh et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo los términos de la licencia Creative Commons Attribution License, que permite el usoilimitado, distribución y reproducción en cualquier medio, siempre que el autor original y la fuente se acrediten.
Financiación: El Centro Pharmabiotic Alimentaria es un centro de investigación financiado por la Science Foundation Ireland (SFI), a través del Plan Nacional de Desarrollo del Gobierno Irlandés. Los autores y sus trabajos fueron apoyados por SFI CSET subvención APC CSET 2 subvención07/CE/B1368. Los financiadores no tenían parte en el diseño del estudio, recogida y análisis de datos, decisión de publicar, ni en la preparación del manuscrito
Conflicto de intereses: Los autores han declarado que no existen conflictos de intereses.

INTRODUCCIÓN
El kéfir es una leche fermentada. Se trata de una bebida ácida viscosa, auto-gasificada, que contiene un bajo porcentaje de alcohol y secree que se originó en las montañas del Cáucaso hace unos 2.000 años. La leche es fermentada por una matriz sólida, similar a la coliflor, polisacárido conocido como grano de kéfir, que se reutiliza para iniciar fermentaciones posteriores. El grano se compone principalmente de kefiran producido por bacterias [1], que contiene en su interior un complejo consorcio de bacterias y levaduras que...