Selección Genómica

ARTÍCULO: PLAN DE IMPLANTACIÓN DE LA SELECCIÓN GENÓMICA EN LA
POBLACIÓN DE VACUNO DE LECHE EN ESPAÑA
ABSTRACT
Study on the article by González-Recio, O. , Carabaño, M. J., Pena, J. 2, Diaz, C. ,
Ugarte, E. 3y Alenda, R. : Plan of implementation of genomic selection in dairy cattle
population in Spain.
In this small study has sought to explain easily what a SNP, genomic evaluations anddirect genomic value (VGD) genotyping test and situation in Spain.

La selección genómica consiste en utilizar la información disponible del ADN de las vacas o
toros como un dato adicional para predecir sus valores genéticos y basándose en esos valores
genéticos “mejorados” tomar las decisiones de selección. La gran ventaja es que la
información sobre el ADN se puede tener al nacimiento delanimal, a partir de una muestra de
sangre.
Secuenciación y SNP
El ADN está compuesto por dos cadenas paralelas de bases químicas, llamadas nucleótidos.
Estas pueden ser de cuatro tipos: adenina (A), guanina (G), citosina (C) y timina (T). En el
año 2000 se secuenció el genoma humano, lo que se consiguió fue conocer el orden exacto en
el que aparecían estos cuatro nucleótidos en los cromosomas deuna serie de individuos .
La trascendencia de haber secuenciado el genoma de varios individuos es debida a que la
mayor parte del genoma es igual en todas las personas. Las variaciones son debidas a los
cambios que se han ido dando en el ADN a lo largo del tiempo, pero representan una pequeña
parte del total de bases del genoma. Un SNP (polimorfismo de un solo nucleótido) es una
variación enla secuencia de ADN que afecta a una sola base. Se les denomina “snips” y son
el tipo de variación más frecuente en el ADN, constituyen hasta el 90% de todas las
variaciones genómicas humanas. Cualquier base del ADN podría ser sustituida por cualquier
otra, pero, en la práctica, la mayoría de los SNP sólo tienen dos variantes o alelos.
En 2004 se secuenció el genoma bovino. A partir de estainformación, a finales de 2007
comenzó la comercialización de un chip que permite conocer a un precio asequible
(aproximadamente 200 euros) la información exacta que presenta cada toro o vaca en 54.000
SNP (“50K”). Aquí comienza
la selección genómica en vacuno de leche.
Cuando hablamos del genotipo de un toro en este contexto de selección genómica, nos
referimos a la información que presentael toro en los 54.000 SNP integrados en el chip
comercial, aunque en realidad el término genotipo engloba el total del ADN del animal.
Los SNP no tienen porqué formar parte de los genes. Pero, si están bien distribuidos a lo largo
del genoma, muchos de ellos estarán próximos a zonas del ADN responsables de caracteres
de interés, es decir, estarán asociados a genes. El objetivo será identificarestas asociaciones
entre los SNP y las distintas características que interesa estudiar en los individuos. Por eso se
dice que los SNP son “marcadores genéticos”.

Evaluaciones genómicas
Las evaluaciones genómicas consisten en establecer unas “fórmulas” o “ecuaciones de
predicción” mediante las que, a partir de la información que tiene un animal determinado en
cada uno de los miles de SNPconsiderados, se predice su mérito genético en cada uno de los
caracteres. Las pruebas así obtenidas se denominan valor genómico “directo”, porque no se
basan nada más que en los genotipos de los toros. Estos valores genómicos directos se
incorporan posteriormente en las evaluaciones genéticas tradicionales aumentando su
fiabilidad.
Para poder calcular los valores genómicos directos en un países necesario disponer de los
genotipos de los toros que tienen prueba en ese país y asociar las pruebas a los genotipos, para
obtener las “fórmulas” que predicen los méritos genéticos a partir de los genotipos. Ese grupo
de toros con el que se calculan las “fórmulas” de predicción del valor genómico directo se
llama “población de referencia”. Un aspecto clave es que cuanto mayor sea el...