Seminario Proteinas

Preguntas Seminario 2

Seminario aminoácidos-estructura y función de proteínas


1:- Explique las características de un enlace peptídico y mencione la importancia que tienen estas características en las estructuras tridimensionales de la cadena polipeptídica.

La unión de dos o más aminoácidos mediante enlaces amida origina los péptidos. En los péptidos y en las proteínas, estos enlacesamida reciben el nombre de enlaces peptídicos y son el resultado de la reacción del grupo carboxilo de un aminoácido con el grupo amino de otro, con eliminación de una molécula de agua, formándose un enlace covalente entre el átomo de carbono y el de nitrógeno (-OC-NH-).
El enlace peptídico, a pesar de ser un enlace simple, tiene cierto carácter de enlace doble. Este carácter parcial de dobleenlace hace que los átomos que participan en este enlace (carbono, nitrógeno, oxígeno e hidrógeno) no puedan moverse unos con respecto a otros y queden en un mismo plano. Sin embargo, los enlaces que se establecen entre los átomos del plano (carbono o nitrógeno) y los carbonos alfa de los aminoácidos enlazados sí tienen carácter de enlace simple y permiten cierto grado de giro. Los aminoácidos secaracterizan por tener un grupo amino y un grupo carboxilo unidos a un mismo átomo de carbono, el carbono alfa. Además del grupo amino y del grupo carboxilo el carbono alfa tiene unido un átomo de hidrógeno y la llamada cadena lateral que es variable y caracteriza a cada tipo de aminoácido. 

Un átomo de carbono que sólo establezca enlaces simples, como es el carbono alfa, presenta estos enlacesdispuestos en una geometría tetraédrica, donde el núcleo atómico está en el centro del tetraedro y cada enlace va desde el centro hacia un vértice. Esta visión de la geometría del átomo de carbono es relevante para comprender que la sucesión de aminoácidos no es una línea recta en el espacio y que el giro entre el carbono alfa y un plano de enlace peptídico es el responsable de la conformaciónque adquiere la secuencia lineal de aminoácidos para establecer la estructura tridimensional (configuración) de la proteína. El giro que puede realizar cada uno de estos enlaces dependerá en gran medida de las cadenas laterales y las posibles interacciones que haya entre ellas y del medio en el que se encuentre la molécula.


2.- ¿Qué son la estructura primaria, secundaria, terciaria ycuaternaria de una proteína?. ¿Qué en enlaces forman parte de cada una de ellas y cuales estabilizan cada estructura?

Primaria: Es la organización mas básica de las proteína. Está determinada por la secuencia de aminoácidos de la cadena proteica, es decir, el número de aminoácidos presentes y el orden en que están enlazados por medio de enlaces peptídicos. (Lineal)
Secundaria: la estructura secundariade las proteínas es el plegamiento regular local entre residuos aminoacídicos cercanos de la cadena polipeptídica. Se adopta gracias a la formación de enlaces de hidrógeno entre los grupos carbonilo (-CO-) y amino (-NH-) de los carbonos involucrados en las uniones peptídicas de aminoácidos cercanos en la cadena. (Helice)
Terciaria: La estructura terciaria de las proteínas es el modo en el quela cadena polipeptídica se pliega en el espacio. Es la disposición de los dominios en el espacio es decir esta adquiere forma tridimensional de manera precisa como en las proteinas globulares.
La estructura terciaria posee cantidades variables de helices-alfa y beta y otras con una estructura flexible que puede cambiar al azar.
La estructura terciaria se realiza de manera que los aminoácidosapolares se sitúan hacia el interior y los polares hacia el exterior. (Puentes disulfuro y doblada)
Cuaternaria: deriva de la conjunción de varias cadenas peptídicas que, asociadas, conforman un ente, un multímero, que posee propiedades distintas a la de sus monómeros componentes. Dichas subunidades se asocian entre sí mediante interacciones no covalentes, como pueden ser puentes de hidrógeno,...