Sequencing genomics
Páginas: 2 (428 palabras)
Publicado: 6 de octubre de 2010
Name: José A. López Quintero Date: 26/sept/10
Electropherogram Interpretation Worksheet
A C T T C T T G C C A C T G G T T G C T G C A A G
G A G T A A T A CA G A G C G A G A G G A CG A C A
A T T T G C T C C N C A A N G A A T T G C G A A A A
C T A N T T C T T A NA C T A N A N C N A N A G C N NName: José A. López Quintero Date: 26/sept/10
From Signal to Sequence Discussion Questions
1. What is the role of a finisher in the process of DNA sequencing?
El finalizador analiza elelectroferograma y las secuencias de consenso provisto por los programas Phred y Phrap, para demostrar si el consenso es preciso con la secuencia, de no poder conseguir una lectura completa este através de reacciones adicionales trata de lograr una secuencia de alta calidad para colectar una mejor data.
2. What is an electropherogram? What is a consensus sequence, and how is this differentfrom an electropherogram?
Un electroferograma es una representación gráfica de la data recibida a través de la interpretación de imágenes capturadas por una maquina secuenciadora electroforéticaautomatizada conocida como “trace”.
La secuenciación por consenso consiste en un análisis generado de cálculos algorítmicos de múltiples lecturas de nucleótidos. Se diferencian en la informaciónusada, en el caso del electroferograma es un análisis gráfico y la secuenciación es un análisis de letras.
3. What is one cause of uncertainty in data received from an electropherogram? Explain whythis particular characteristic or feature is problematic.
Las repeticiones invertidas al igual que las repeticiones Tandem (uno o varios patrones repetitivos de nucleótidos durante una extensiónde secuencia de ADN adyacente) pueden causar confusión en la lectura ya que estas repeticiones tienden a ser difíciles de leer, teniendo que realizar más pruebas hasta garantizar la certeza de la...
Electropherogram Interpretation Worksheet
A C T T C T T G C C A C T G G T T G C T G C A A G
G A G T A A T A CA G A G C G A G A G G A CG A C A
A T T T G C T C C N C A A N G A A T T G C G A A A A
C T A N T T C T T A NA C T A N A N C N A N A G C N NName: José A. López Quintero Date: 26/sept/10
From Signal to Sequence Discussion Questions
1. What is the role of a finisher in the process of DNA sequencing?
El finalizador analiza elelectroferograma y las secuencias de consenso provisto por los programas Phred y Phrap, para demostrar si el consenso es preciso con la secuencia, de no poder conseguir una lectura completa este através de reacciones adicionales trata de lograr una secuencia de alta calidad para colectar una mejor data.
2. What is an electropherogram? What is a consensus sequence, and how is this differentfrom an electropherogram?
Un electroferograma es una representación gráfica de la data recibida a través de la interpretación de imágenes capturadas por una maquina secuenciadora electroforéticaautomatizada conocida como “trace”.
La secuenciación por consenso consiste en un análisis generado de cálculos algorítmicos de múltiples lecturas de nucleótidos. Se diferencian en la informaciónusada, en el caso del electroferograma es un análisis gráfico y la secuenciación es un análisis de letras.
3. What is one cause of uncertainty in data received from an electropherogram? Explain whythis particular characteristic or feature is problematic.
Las repeticiones invertidas al igual que las repeticiones Tandem (uno o varios patrones repetitivos de nucleótidos durante una extensiónde secuencia de ADN adyacente) pueden causar confusión en la lectura ya que estas repeticiones tienden a ser difíciles de leer, teniendo que realizar más pruebas hasta garantizar la certeza de la...
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