Simon

Páginas: 4 (981 palabras) Publicado: 6 de enero de 2013
Alineador e Identificador de similaridades funcionales, estructurales y evolutivas para dos secuencias biológicas
http://www.ebi.ac.uk/Tools/psa/
Alineamiento Global: Crear un alineamiento deprincipio a fin en las secuencias puede ser proteicas o nucleotidicas
Needle: Para secuencias cortas
Streetcher: Para secuencias largas
Alineamiento Local: encuentra uno o mas alineamientosdescribiendo las regiones mas similares de las secuencias
Water: Alineamiento de regiones similares
Matcher: Alineamiento de regiones similares
LALIGN: Encuentra duplicaciones internasAlineamiento Genomico: Alinea secuencias buscando características presentes en la secuencia
Wise2DBA: Alinea secuencias conservativas separadas por grandes partes de nucleotidos
GeneWise: Compara unaproteína con una secuencia de ADN genómico, permitiendo observas intrones, exones, etc
PromoterWise: Alinea 2 secuencias de ADN permitiendo su inversión o traslocacion ideal para promotoresAlineamiento de secuencias múltiples e Identificador de similaridades funcionales, estructurales y evolutivas
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/
Buscador de marcos de lecturas disponibleshttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
Buscador los términos Mesh
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh
Buscador Contigs, Traces, Consensus Length, Gapshttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/assembly/assmbrowser.cgi
Buscador de secuencias similares a la ingresada a partir de una base de datos, puede modificar sensibilidad para secuencias poco similares
http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/wublast/
Buscador desecuencias similares a la ingresada a partir de una base de datos, puede excluir a un tipo de organismo, y además tienes las opciones de
Optimize for Highly similar sequences (megablast)
Optimizefor More dissimilar sequences (discontiguous megablast)
Optimize for Somewhat similar sequences (blastn)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl2seq/wblast2.cgi
Conversor de secuencias a formatos...
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