simulación con dinámica molecular

EVALUACIÓN DE LAS INTERACCIONES ELECTROSTÁTICAS EN LOS
COMPLEJOS ENZIMA-INHIBIDOR: SCTIM-2PG Y SCTIM-PGH A
DIFERENTES FUERZAS IÓNICAS.
Serratos Álvarez I.1, Pérez Hernández G.2, Garza Ramos G.3 yZubillaga Luna R.1
Departamento de Química, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa. Apartado
Postal 55-534, Iztapalapa, México D.F., C.P 09340; Tel. 58044674. Fax: (55) 58044666,
e-mailzlra@xanum.uam.mx
2
Departamento de Ciencias Naturales, Universidad Autónoma Metropolitana -Cuajimalpa
3
Departamento de Bioquímica, Facultad de Medicina., Universidad Nacional Autónoma de
México
1Las interacciones electrostáticas juegan un papel central en una variedad de procesos
biológicos principalmente en el fenómeno del reconocimiento molecular en proteínas. La
evaluación de lacontribución electrostática a la energía de unión de ligandos con potencial
farmacológico podría ayudar a optimizar la afinidad y especificidad de dichos inhibidores.
Es comúnmente aceptado que la uniónProteína-Inhibidor se debe a una contribución de tipo
polar (p) o electrostática y otra no polar (np) o hidrofóbica, por lo que en el presente trabajo
se evalúo la contribución de las interaccioneselectrostáticas en la energética de asociación
de la enzima Triosafosfato isomerasa de la levadura Saccharomyces cerevisiae (ScTIM) con
dos de sus inhibidores fosforilados más afines: el2-fosfoglicolato (2PG) y el
fosfoglicolohidroxamato (PGH). Para evaluar el peso significativo de cada contribución (p) o
(np) en estos complejos se realizaron experimentos en ausencia y presencia de diferentesconcentraciones de NaCl. Esto se estudia desde un punto de vista experimental como
teórico.
En la parte experimental, se realizaron titulaciones fluorimétricas y calorimétricas para
cuantificarla energética de la asociación de los complejos ScTIM-2PG y ScTIM-PGH,
determinando los valores de los parámetros termodinámicas del proceso: Ku, ∆Gu, ∆Hu, ∆Su
y ∆Cp en presencia de concentraciones...