Técnicas Selectas De Biología Molecular
Aislamiento de RNAt TRIzol 3
Gel de Agarosa al 1% para RNAt 4
Aislamiento de DNA (fenol-cloroformo) 5
Reacción de RT 6
Reacciones de PCR 7
PCR convencional 7
Reacciones de PCR Mix 7
Reacción de qPCR 8
Clonación 9
Macroarreglos 10
Preparación de sonda 10
Hibridación 10
Detección 11
Revelado 11
Reactivos 13
MOPS 10X 13
Buffer carga para RNAt (Gel de agarosa al1% desnaturalizante) 13
Solución Salina para Camarón SIC-EDTA 13
Tubos libres de Pirogenos 13
Monómero de acrilamida 14
Buffer de Separación 14
APS 10% 14
Aislamiento de RNAt TRIzol
1. Extracción de los Hc con anticoagulante (Tejido), centrifugar cell a 800g por 10 min.
2. Agregar al paquete cell 750 µl de TRIzol a Temp. Ambiente, y homogenizar.
3.Agregar 250 µl de H2O-DEPC (vol final 1ml) e incubar a Temp. Amb 5 min.
4. Agregar 200 µl de cloroformo, agitar suavemente e incubar a Temp. Amb 10 min (LAVADO 1)
5. Centrifugar a 12,000 g a 4°C por 15 min.
6. Recuperar el sobrenadante a otro tubo aprox. 500 µl.
7. Agregar 200 µl de cloroformo, agitar suavemente e incubar a Temp. Amb 10 min (LAVADO 2)8. Centrifugar a 12,000 g a 4°C por 15 min.
9. Recuperar el sobrenadante a otro tubo aprox. 500 µl.
10. Precipitar el RNA con 500 µl de isopropanol e incubar a Temp. Amb 10 min.
11. Centrifugar a 12,000 g a 4°C por 10 min.
12. Descartar el sobrenadante y lavar con 1ml de etanol al 75%(DEPC), aplicar vortex
13. Centrifugar 5 min a 4°C a 7,500g14. Descartar el sobrenadante y secar a Tem. Amb. o en vacufugue pegados ala pared.
15. Re suspender en 100µl H2O-DEPC.
16. Cuantificar 260/280 nm.
Gel de Agarosa al 1% para RNAt
0.3% de Agarosa
3ml de MOPS 10X
25.3ml de H2O-DEPC
Se disuelve con calor y se deja enfriar aprox 50(C se agrega 1.23ml de formaldehído al 37%. Vaciar en la placa30ml para la formación del gel.
Nota: el bromuro de etidio se agrega a la muestra (1(l de 1(g/ml) ya que si se agrega al gel por causa del formaldehído se sobretiñe y las bandas no se alcanzan a observar. También se le adiciona ala muestra 1(l de Buffer carga para RNAt.
Nota: El buffer de corrida es el MPOS 1X que se prepara a partir del MPOS 10X diluyendo con H2O-DEPC.
Aislamiento deDNA (fenol-cloroformo)
1. Extracción de los Hc con SIC-EDTA, centrifugar a 800g por 20 min
2. Se adicionan al paquete cell 500µl de buffer de extracción y homogenizar.
3. Agredar 10 µl de RNAasa (20µg/ml)
4. Incubar 1h a 37°C.
5. Se adicionan 2µl de proteinaza K (2 µg/ml)
6. Incubar por 3h a 55°C, con agitación ocasional
7. Se agregan 500µl de fenol pH 7.3 yhomogenizar, dejar reposar 3 min.
8. Centrifugar a 14,000 rpm por 20 min, y separar el sobre (fase acuosa).
9. Agregar 500µl de cloroformo, homogenisar.
10. Centrifugar a 14,000 rpm por 10 min, y separar el sobre (fase acuosa).
11. Agregar 500µl de fenol:cloroformo:alcohol isoamilico (25:24:1) y agitar.
12. Centrifugar durante 20 min a 14,000 rmp, y separar el sobre(fase acuosa).
13. Agregar un volumen de cloroformo y mezclar con vortex (1 o 2 veces)
14. Centrifugar por 5 min a 12,000 rpm y separar el sobre (fase acuosa).
15. Precipitar con 2 vol. de etanol absoluto y (el vol total/10) de NaCl 5M.
16. Incubar a –70°C por toda la noche o 2h.
17. Centrifugar a 14,000 rpm y vaciar a otro tubo.
18. Tirar el sobre, lavar el pp con 1 mlde etanol al 70% agitar suavemente.
19. Centrifugar a 14,000 rpm por 5 min.
20. Tirar el sobre y secar en el SAVAT de 5min a 30°C (Evaporar todo).
Reacción de RT
|Reactivos |1Rx |
|5X First-Strand Buffer |4(l |
|DTT(0.1M) |2(l...
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