Tecs Informacion
* Bibliografía Básica
* Achuthsankar S Nair Computational Biology & Bioinformatics - A gentle Overview, Communications of Computer Society of India, enero de 2007
* Edición especial de Philosophical Transactions B sobre bioinformática, accesible libremente
* Catalyzing Inquiry at the Interface of Computing and Biology (2005) CSTB report
* Calculating theSecrets of Life: Contributions of the Mathematical Sciences and computing to Molecular Biology (1995)
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Bioinformática
La bioinformática, según una de sus definiciones más sencillas, es la aplicación de tecnología de computadores a la gestión y análisis de datos biológicos.1 Los términos bioinformática,biología computacional y, enocasiones, biocomputación, utilizados en muchas situaciones como sinónimos,2 3 hacen referencia a campos de estudios interdisciplinares muy vinculados que requieren el uso o el desarrollo de diferentes técnicas estudiadas universitariamente en la Ingeniería Informática como ciencia aplicada de la disciplina informática.4 Entre estas pueden destarcarse las siguientes:matemáticaaplicada,5 estadística,6 ciencias de la computación,7 inteligencia artificial,8 química9 y bioquímica10 con las que el Ingeniero Informático soluciona problemas al analizar datos, o simular sistemas o mecanismos, todos ellos de índole biológica, y usualmente (pero no de forma exclusiva) en el nivel molecular.11 El núcleo principal de estas técnicas se encuentra en la utilización de recursos computacionales para solucionar oinvestigar problemas sobre escalas de tal magnitud que sobrepasan el discernimiento humano. La investigación en biología computacional se solapa a menudo con la biología de sistemas.12
Los principales esfuerzos de investigación en estos campos incluyen el alineamiento de secuencias, la predicción de genes, montaje del genoma, alineamiento estructural de proteínas,predicción de estructura deproteínas, predicción de la expresión génica, interacciones proteína-proteína, y modelado de la evolución.13
Una constante en proyectos de bioinformática y biología computacional es el uso de herramientas matemáticas para extraer información útil de datos producidos por técnicas biológicas de alta productividad, como la secuenciación del genoma. En particular, el montaje o ensamblado de secuenciasgenómicas de alta calidad desde fragmentos obtenidos tras la secuenciación del ADN a gran escala es un área de alto interés.13 14 Otros objetivos incluyen el estudio de la regulación genética para interpretar perfiles de expresión génica utilizando datos de chips de ADN oespectrometría de masas.15
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Historia
En lo que sigue, y además de los hechosrelevantes directamente relacionados con el desarrollo de la bioinformática, se mencionarán algunos hitos científicos y tecnológicos que servirán para poner en un contexto adecuado tal desarrollo.20
Arrancaremos esta breve historia en la década de los 50 del pasado siglo XX, años en los que Watson y Crick proponen la estructura de doble hélice del ADN (1953),21 se secuencia laprimeraproteína (insulina bovina) por F. Sanger (1955),22 o se construye el primer circuito integrado por Jack Kilby en los laboratorios de Texas Instruments (1958).
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Principales áreas de investigación
Análisis de secuencias
Artículo principal: Base de datos biológica.
Artículo principal: Alineamiento de secuencias.
Desde que el fago Φ-X174 fue secuenciadoen 1977 (secuencia provisional: un año más tarde se publicaría la secuencia completa definitiva),33 las secuencias de ADN de cientos de organismos han sido decodificadas y guardadas en bases de datos. Esos datos son analizados para determinar los genes que codifican para ciertas proteínas, así como también secuencias reguladoras. Una comparación de genes en una especie o entre especies puede...
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