Temas 5

Temas 5.1 y 5.2: Plegamiento de proteínas

Para pasar de un estado desplegado a uno desplegado, es imprescindible un estado de transición, que es el más energético y, por tanto, el menos estable.Estado desplegado
Estado de transición
Estado plegado
Muy energético
Poco estable
El más energético
El menos estable
Poco energético
Muy estable
Carece de función

Funcional











En realidad,hay muy poca diferencia entre la estabilidad del estado plegado y desplegado, pero esto es algo positivo ya que el metabolismo necesita que la proteína sea fácilmente degradable.














Todofavorece el plegamiento a excepción de la entropía, por eso el balance es tan pequeño (5-10 kcal/mol).
Cooperatividad en el plegamiento:
















Cinética del plegamiento: estados intermedios.1. Paradoja de Levinthal:

Una hipótesis dice que las proteínas se pliegan al azar, quedando finalmente en su forma más estable.

Suponemos una proteína de 100 aa, cada uno de los cuales puede tener 3conformaciones, esto quiere decir que la proteína tendrá 3100 posibles conformaciones, (o lo que es lo mismo 1048 ) de las cuales, solamente una, que será la del estado plegado es la más estable,será la que la proteína debe adoptar.

Supongamos que la velocidad máxima de formación de cada una de estas posibilidades es 10-13 s/movimiento, por tanto la proteína tardará en llegar a la más estable:10-13·1048 = 10-35 segundos, es decir, 1027 años.
Si el universo se creó aproximadamente hace 1010 años, es imposible que las proteínas se plieguen al azar.

2. Estados intermedios:

Una segundahipótesis afirma que el plegamiento de proteínas puede comenzar afectado por factores del azar, pero después serán los estados intermedios los que conducirán el plegamiento, sin que el azar influya. Estosestados intermedios son estructuras parcialmente plegadas que guían el mecanismo, y por los cuales es imprescindible que pasen todas las proteínas. (En proteínas muy pequeñas se puede observar...