Temas variados
El 9 de junio de 1809, el Tribunal de Fidelidad, afincado en San Miguel, encarceló yconfiscó los bienes de Justo Zaldívar (originario de San Alejo) y Valentín Porras, por ser promotores de «ideas subversivas» contra las autoridades de la corona española.Estos hechos apuntan a que ambos fueron los primeros sujetos en sufrir persecución en el territorio centroamericano por parte del poder colonial. Asimismo, endiciembre de 1811 hubo otra sedición como seguimiento al movimiento independentista de noviembre, pero fue sofocado. En medio de los sucesos Zaldívar trató de huir aHonduras, mas fue encarcelado en San Miguel donde murió.
El 11 de marzo de 1827 la aldea recibió oficialmente el título de «villa». En 1854 pasó a formar parte deldistrito de La Unión y en 1865 fue establecido como municipio del departamento. El 3 de febrero de 1870 obtuvo el título de «ciudad» bajo la administración de FranciscoDueñas. Hacia 1890 en San Alejo vivían alrededor de 2.880 personas. Rafael Zaldívar, presidente de El Salvador en la segunda mitad del siglo XIX, nació en este lugar.
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