teoria microbiana

CAPÍTULO 1
CLASIFICACIÓN MICROBIANA
Carlos G. Osorio A.

Los tres dominios de seres vivos
En la década de los 80´, surgió una nueva visión sobre la clasificación de los seres
vivos y sus posibles relaciones evolutivas, provocando una verdadera revolución en la biología
moderna. Para entender esta revolución debemos primero conocer cuál era el conocimiento
que había entrado en crisis. Elllamado paradigma clásico consideraba que la clasificación
natural de los seres vivos comprendía sólo dos grandes clases de organismos: Procariontes
(células sin núcleo) y Eucariontes (células con núcleo)1. Estas dos grandes clases se
diferenciaban profundamente a nivel de su estructura y organización subcelular, por lo que se
les consideró siempre como grupos excluyentes. Además, estas clasesde organismos eran
agrupadas en 5 reinos (Whittaker, 1969), conformando los procariontes por si sólos el llamado
reino Monera o Prokaryota (considerado primitivo o ancestral). Los 4 reinos eucariontes
restantes Protozoa, Hongo, Plantae y Animalia serían reinos derivados del reino Monera (más
evolucionados (Figura 1-1).

Reino Animalia

Reino Hongo

Reino Plantae

Reino Protozoaeucariontes

procariontes

Reino Monera

Figura 1-1: Esquema de los 5 reinos clásicos de Whittaker y sus relaciones
evolutivas: reino Metazoa (Animalia), reino Metafita (Plantae),
reino Fungi (Hongo), reino Protista (Protozoa) y reino Monera
(Procariota) (ver Whittaker & Margulis, 1978).
En el año 1978 se descubre un nuevo tipo de seres vivos, tan distantes evolutivamente
de las bacteriascomo de los eucariontes, siendo llamados primeramente arquibacterias. En el
año 1990 se incorporan estos descubrimientos a una nuevo esquema sobre la evolución y
1

Ambos términos derivados del griego καρυον cuyo significado es nuez
3

4
Clasificación de los microorganismos
¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯

clasificación de los seres vivos,planteando que la evolución habría ocurrido en tres líneas o
linajes filogenéticos principales, y no en dos como postulaba el paradigma clásico (Wheelis et
al., 1992; Woese et al., 1990). Esta nueva visión se caracteriza por considerar a las
arquibacterias, actualmente denominadas simplemente arquea, como una tercera forma de
vida, muy diferentes a los eucariontes y procariontes clásicos. Todosestos cambios y nuevas
propuestas han sido posibles gracias al estudio y comparación de secuencias de
macromoléculas conservadas en todos los seres vivos (denominadas relojes moleculares), tales
como el ARN ribosomal (especialmente el ARNr 16S) y algunas proteínas conservadas tales
como los factores traduccionales EF-G y EF-Tu.
Para poder comprender el giro paradigmático ocurrido en las dosúltimas décadas,
debemos comenzar entonces por presentar el nuevo árbol filogenético propuesto para la
evolución de los seres vivos. Esta nueva clasificación se basa en una visión tricotómica (tres
linajes principales) e incorpora un nuevo nivel o rango taxonómico denominado Dominio
(superior a Reino). Estos tres nuevos linajes evolutivos reciben entonces las siguientes
denominaciones: dominioEucaria, dominio Arquea y dominio Bacteria (Figura 1-2).
Si observamos el árbol filogenético universal de la figura 1-2, notaremos que dentro
del dominio Bacteria existen varios linajes bacterianos diferentes (1-6). Cada uno de ellos
estrictamente debería corresponder a un reino diferente, sin embargo por razones de índole
histórica se les denomina Divisiones o Phyla. Hoy en día se describen 80Divisiones o Phyla
en el dominio Bacteria, siendo la gran mayoría de estas bacterias fotolitotróficas,
quimiolitotróficas, ambientales y no patógenas para el hombre. Muchas de ellas son
fundamentales en varios ciclos geoquímicos de nuestro planeta (carbono, nitrógeno, fósforo,
etc.).

Figura 1-2: Árbol filogenético universal propuesto en 1990. Este árbol filogenético
se basa en la...