trabajo bioinformatica terminado
Páginas: 14 (3262 palabras)
Publicado: 30 de junio de 2015
TRABAJO DE ANALISIS BIOINFORMATICO
El gen de interés es la rodopsina que es una proteína transmembranal que se encuentra en los discos de los bastones de la retina. Consta de una parte proteica, opsina, y una no proteica que es un derivado de la vitamina A que es el 11-cis-retinal. Es inestable y se altera fácilmente con la energía luminosa, se decolora y descompone por exposición a laluz y se regenera con la oscuridad.
La secuencia que codifica para esa proteína se encuentra enseguida la cual mediante un análisis bioinformatico conoceremos que organismos producen o tienen la secuencia del gen o la secuencia que codifican para la proteína.
> Homo sapiensATGAATGGCACAGAAGGCCCTAACTTCTACGTGCCCTTCTCCAATGCGACGGGTGTGGTACGCAGCCCCTTCGAGTACCCACAGTACTACCTGGCTGAGCCATGGCAGTTCTCCATGCTGGCCGCCTACATGTTTCTGCTGATCGTGCTGGGCTTCCCCATCAACTTCCTCACGCTCTACGTCACCGTCCAGCACAAGAAGCTGCGCACGCCTCTCAACTACATCCTGCTCAACCTAGCCGTGGCTGACCTCTTCATGGTCCTAGGTGGCTTCACCAGCACCCTCTACACCTCTCTGCATGGATACTTCGTCTTCGGGCCCACAGGATGCAATTTGGAGGGCTTCTTTGCCACCCTGGGCGGTGAAATTGCCCTGTGGTCCTTGGTGGTCCTGGCCATCGAGCGGTACGTGGTGGTGTGTAAGCCCATGAGCAACTTCCGCTTCGGGGAGAACCATGCCATCATGGGCGTTGCCTTCACCTGGGTCATGGCGCTGGCCTGCGCCGCACCCCCACTCGCCGGCTGGTCCAGGTACATCCCCGAGGGCCTGCAGTGCTCGTGTGGAATCGACTACTACACGCTCAAGCCGGAGGTCAACAACGAGTCTTTTGTCATCTACATGTTCGTGGTCCACTTCACCATCCCCATGATTATCATCTTTTTCTGCTATGGGCAGCTCGTCTTCACCGTCAAGGAGGCCGCTGCCCAGCAGCAGGAGTCAGCCACCACACAGAAGGCAGAGAAGGAGGTCACCCGCATGGTCATCATCATGGTCATCGCTTTCCTGATCTGCTGGGTGCCCTACGCCAGCGTGGCATTCTACATCTTCACCCACCAGGGCTCCAACTTCGGTCCCATCTTCATGACCATCCCAGCGTTCTTTGCCAAGAGCGCCGCCATCTACAACCCTGTCATCTATATCATGATGAACAAGCAGTTCCGGAACTGCATGCTCACCACCATCTGCTGCGGCAAGAACCCACTGGGTGACGATGAGGCCTCTGCTACCGTGTCCAAGACGGAGACGAGCCAGGTGGCCCCGGCCTAA
El cual codifica para la secuencia de proteína la cual se muestra a continuación:
> Homo sapiensMNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA
Se realizo un Blast con 10 organismos el cual sus resultados se arrojan a continuacion
BLAST
Se presenta la secuencia de nucleótidos del Oryctolagus cuniculus (conejo)asi como su secuencia de aminoácidos.
> OryctolaguscuniculusAAGGCCGCAGCATGAACGGAACGGAGGGCCCGGACTTCTACATACCCATGTCCAACCAGACAGGCGTGGTGCGCAGCCCCTTCGAGTACCCGCAGTACTACCTGGCCGAGCCCTGGCAGTTCTCCATGCTGGCCGCCTACATGTTCCTGCTCATCGTGCTCGGCTTCCCCATCAACTTCCTCACGCTCTACGTCACCGTGCAGCACAAGAAGCTGCGCACGCCCCTCAACTACATCCTGCTCAACCTGGCTGTGGCTGACCTCTTCATGGTCCTTGGGGGCTTCACCACCACCCTGTACACCTCCCTGCATGGCTACTTCGTCTTCGGGCCCACGGGATGCAACGTGGAGGGCTTCTTTGCCACGCTGGGCGGTGAAATTGCGCTGTGGTCCCTGGTGGTCCTGGCCATCGAGCGGTACGTGGTGGTGTGCAAGCCCATGAGCAACTTCCGCTTCGGCGAGAACCACGCCATCATGGGTGTTGCCTTCACCTGGATCATGGCCCTGGCCTGTGCCGCGCCGCCCCTCGTCGGCTGGTCCAGGTACATCCCTGAGGGCATGCAGTGCTCGTGCGGAATCGACTACTACACGCTCAAGCCCGAGGTCAACAACGAGTCGTTCGTCATCTATATGTTCGTGGTCCACTTCACCATCCCTTTGATCATCATCTTCTTCTGCTACGGGCAGCTCGTCTTTACTGTCAAGGAGGCAGCTGCCCAGCAGCAGGAGTCGGCCACCACGCAGAAGGCAGAGAAGGAAGTGACCCGCATGGTCATCATCATGGTCATCGCCTTCCTGATCTGCTGGGTGCCCTACGCCAGCGTGGCGTTCTACATCTTCACCCACCAGGGCTCCAACTTCGGGCCCATCTTCATGACCATCCCGGCGTTCTTCGCCAAGAGCTCCTCCATCTACAACCCTGTCATCTACATCATGATGAACAAGCAGTTCCGGAACTGCATGCTCACCACCATCTGCTGCGGCAAGAACCCACTGGGTGACGACGAGGCCTCTGCCACGGCTTCCAAGACGGAGACCAGCCAGGTGGCCCCGGCCTAAGCACTGCCAGGGACTCCGTGGCCGACTGTAGGAGTCTCCCATCCCTCACACCCCACCCCCAGCCACAGCCACCCCACCAGGAGCCGCGCCTGTCAGAACCAAGCTTGCAGGCTCCGTGAGAGGGTTGTTTTCCCCTAAAG
> Oryctolagus cuniculus rhodopsin
MNGTEGPDFYIPMSNQTGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTTTLYTSLHGYFVFGPTGCNVEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWIMALACAAPPLVGWSRYIPEGMQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPLIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSSSIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATASKTETSQVAPA
Se...
El gen de interés es la rodopsina que es una proteína transmembranal que se encuentra en los discos de los bastones de la retina. Consta de una parte proteica, opsina, y una no proteica que es un derivado de la vitamina A que es el 11-cis-retinal. Es inestable y se altera fácilmente con la energía luminosa, se decolora y descompone por exposición a laluz y se regenera con la oscuridad.
La secuencia que codifica para esa proteína se encuentra enseguida la cual mediante un análisis bioinformatico conoceremos que organismos producen o tienen la secuencia del gen o la secuencia que codifican para la proteína.
> Homo sapiensATGAATGGCACAGAAGGCCCTAACTTCTACGTGCCCTTCTCCAATGCGACGGGTGTGGTACGCAGCCCCTTCGAGTACCCACAGTACTACCTGGCTGAGCCATGGCAGTTCTCCATGCTGGCCGCCTACATGTTTCTGCTGATCGTGCTGGGCTTCCCCATCAACTTCCTCACGCTCTACGTCACCGTCCAGCACAAGAAGCTGCGCACGCCTCTCAACTACATCCTGCTCAACCTAGCCGTGGCTGACCTCTTCATGGTCCTAGGTGGCTTCACCAGCACCCTCTACACCTCTCTGCATGGATACTTCGTCTTCGGGCCCACAGGATGCAATTTGGAGGGCTTCTTTGCCACCCTGGGCGGTGAAATTGCCCTGTGGTCCTTGGTGGTCCTGGCCATCGAGCGGTACGTGGTGGTGTGTAAGCCCATGAGCAACTTCCGCTTCGGGGAGAACCATGCCATCATGGGCGTTGCCTTCACCTGGGTCATGGCGCTGGCCTGCGCCGCACCCCCACTCGCCGGCTGGTCCAGGTACATCCCCGAGGGCCTGCAGTGCTCGTGTGGAATCGACTACTACACGCTCAAGCCGGAGGTCAACAACGAGTCTTTTGTCATCTACATGTTCGTGGTCCACTTCACCATCCCCATGATTATCATCTTTTTCTGCTATGGGCAGCTCGTCTTCACCGTCAAGGAGGCCGCTGCCCAGCAGCAGGAGTCAGCCACCACACAGAAGGCAGAGAAGGAGGTCACCCGCATGGTCATCATCATGGTCATCGCTTTCCTGATCTGCTGGGTGCCCTACGCCAGCGTGGCATTCTACATCTTCACCCACCAGGGCTCCAACTTCGGTCCCATCTTCATGACCATCCCAGCGTTCTTTGCCAAGAGCGCCGCCATCTACAACCCTGTCATCTATATCATGATGAACAAGCAGTTCCGGAACTGCATGCTCACCACCATCTGCTGCGGCAAGAACCCACTGGGTGACGATGAGGCCTCTGCTACCGTGTCCAAGACGGAGACGAGCCAGGTGGCCCCGGCCTAA
El cual codifica para la secuencia de proteína la cual se muestra a continuación:
> Homo sapiensMNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLHGYFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNNESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSAAIYNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA
Se realizo un Blast con 10 organismos el cual sus resultados se arrojan a continuacion
BLAST
Se presenta la secuencia de nucleótidos del Oryctolagus cuniculus (conejo)asi como su secuencia de aminoácidos.
> OryctolaguscuniculusAAGGCCGCAGCATGAACGGAACGGAGGGCCCGGACTTCTACATACCCATGTCCAACCAGACAGGCGTGGTGCGCAGCCCCTTCGAGTACCCGCAGTACTACCTGGCCGAGCCCTGGCAGTTCTCCATGCTGGCCGCCTACATGTTCCTGCTCATCGTGCTCGGCTTCCCCATCAACTTCCTCACGCTCTACGTCACCGTGCAGCACAAGAAGCTGCGCACGCCCCTCAACTACATCCTGCTCAACCTGGCTGTGGCTGACCTCTTCATGGTCCTTGGGGGCTTCACCACCACCCTGTACACCTCCCTGCATGGCTACTTCGTCTTCGGGCCCACGGGATGCAACGTGGAGGGCTTCTTTGCCACGCTGGGCGGTGAAATTGCGCTGTGGTCCCTGGTGGTCCTGGCCATCGAGCGGTACGTGGTGGTGTGCAAGCCCATGAGCAACTTCCGCTTCGGCGAGAACCACGCCATCATGGGTGTTGCCTTCACCTGGATCATGGCCCTGGCCTGTGCCGCGCCGCCCCTCGTCGGCTGGTCCAGGTACATCCCTGAGGGCATGCAGTGCTCGTGCGGAATCGACTACTACACGCTCAAGCCCGAGGTCAACAACGAGTCGTTCGTCATCTATATGTTCGTGGTCCACTTCACCATCCCTTTGATCATCATCTTCTTCTGCTACGGGCAGCTCGTCTTTACTGTCAAGGAGGCAGCTGCCCAGCAGCAGGAGTCGGCCACCACGCAGAAGGCAGAGAAGGAAGTGACCCGCATGGTCATCATCATGGTCATCGCCTTCCTGATCTGCTGGGTGCCCTACGCCAGCGTGGCGTTCTACATCTTCACCCACCAGGGCTCCAACTTCGGGCCCATCTTCATGACCATCCCGGCGTTCTTCGCCAAGAGCTCCTCCATCTACAACCCTGTCATCTACATCATGATGAACAAGCAGTTCCGGAACTGCATGCTCACCACCATCTGCTGCGGCAAGAACCCACTGGGTGACGACGAGGCCTCTGCCACGGCTTCCAAGACGGAGACCAGCCAGGTGGCCCCGGCCTAAGCACTGCCAGGGACTCCGTGGCCGACTGTAGGAGTCTCCCATCCCTCACACCCCACCCCCAGCCACAGCCACCCCACCAGGAGCCGCGCCTGTCAGAACCAAGCTTGCAGGCTCCGTGAGAGGGTTGTTTTCCCCTAAAG
> Oryctolagus cuniculus rhodopsin
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