Variacion genetica de la papaya

Variaciones genéticas de Carica papaya en Puerto Rico (2013)
Berrios, Keyla; Nieves, Nataina; Padilla, Angélica; Ayala, Nikole; Toro, Gladys
Universidad de Puerto Rico
Recinto Universitario de Mayagüez
BIOL 3300-066L

Abstract
La papaya es una fruta que se siembra en las zonas tropicales y subtropicales del mundo y es muy conocida por tener varios beneficios en la salud y en medicinanatural. El objetivo principal de la investigación es determinar cuanta variedad genética hay de esta fruta tropical en Puerto Rico. En la metodología se hizo la extracción de DNA, PCR para amplificación y electroforesis de los geles de agarosa y poliacrilamida. Los resultados demostraron los siguiente, en el gel de agarosa genómica se hizo la extracción de DNA de la fruta adecuadamente, en el gelde agarosa al 3%, se pudo observar variabilidad genética en algunas de las muestras menos en los iniciadores 3 y 5 algunas de sus muestras no se expresó y en el gel de poliacrilamida, la mayoría de los iniciadores se observó una gran variabilidad de estos fragmentos de DNA. Se concluyó que hubo semejanza entre las extracciones de DNA 3 y 4 y 4 variabilidades genéticas.

Introducción
La papaya(Carica papaya) es una fruta que se cultiva y crece abundantemente en las regiones tropicales y subtropicales y es muy conocido por sus beneficios en la salud y sus usos en la medicina natural. El genoma de esta fruta tropical es relativamente pequeño, consiste de 372 mega bases, es diploide y contiene 9 pares de cromosomas, tiene un sistema transformación bien establecida y esta planta florecetodo el año. La papaya es la fruta número uno en las calificaciones nutricionales entres las 38 frutas más comunes, esto es basado en los porcentajes en los Consumos Recomendados Diaria en los Estados Unidos para la vitamina A, vitamina C, potasio, tiamina, niacina, hierro, calcio, riboflavina y fibra. El consumo de la papaya es recomendada para la deficiencia de vitamina A, esto ocurre en niñosque son ciegos en países en desarrollo en zonas tropicales y subtropicales. La fruta, hoja, tallo y las raíces son usados en una gran variedad de usos en la medicina que esto incluye la producción de la papaína, una enzima proteolítica muy valiosa. (Ming et. al. 2008).
Para facilitar en la investigación de la variedad de la papaya se utilizó PCR. PCR o “Polymerase Chain Reaction” es unaherramienta que se utiliza mucho en la biología molecular que ha sido exitoso en el descubrimiento de las enzimas de restricción y el “Southern blot”. Esta herramienta es bien sensitiva que ha amplificada una sola molécula de ADN y copias de genes que ha sido extraído rutinariamente de mezclas de complejos de secuencias genómicas y sido visualizada en bandas como en el gel de agarosa. También puede serutilizado en “rapid screening” y/o secuenciación de inserción de alícuotas de placas individuales o colonias de bacterias. Este instrumento mejora en la polimerasa de ADN termoestable y automación inventada por Kary Mullins, que fomentó el desarrollo de varios usos y aplicaciones del PCR a través de la comunidad científica (Innis et. al. 1990).
Para complementar el PCR, se usan microsatélites o“simple sequence repeats” (SSRs). Estos se encontraron y caracterizados dentro de una proteína que codifica genes y sus regiones sin traducir conocidos como UTRs. Las distribuciones de los micros satélites son expresados en las etiquetas de secuenciación expresadas (ESTs) e incluyendo los genes que codifican para proteínas, 3’-UTRs y 5’-UTRs e intrones. Estos son distribuidos al azar a través deregiones de proteínas codificantes, UTRs e intrones. La indicación que las expansiones y/o contracciones en las regiones de estas proteínas codificantes pueden ganar o perder una función de un gen por mutación o ARN toxico que ha sido expandido. Expansión de los SSR en 3’-UTRs causa retraso en la transcripción y producir mRNA expandido, que puede ser acumulado en el foco nuclear y puede interrumpir...